Protein–RNA interactions for Protein: P32302

CXCR5, C-X-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR5P32302 SH3TC1-201ENST00000245105 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 PCDHB9-201ENST00000316105 4415 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 ZNF185-205ENST00000370270 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 CLGN-201ENST00000325617 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 MMD2-203ENST00000406755 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 MED16-204ENST00000395808 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 AC090617.6-201ENST00000572790 443 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 ARMCX2-202ENST00000330154 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 ZNF571-AS1-203ENST00000586139 2684 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 RNFT2-201ENST00000257575 3882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 KLHL24-211ENST00000476808 2126 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 HSPA8P9-201ENST00000485881 1943 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 AC009501.1-201ENST00000429952 2069 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 ZSCAN32-202ENST00000396846 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 ZSCAN32-203ENST00000396852 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 GPR39-201ENST00000329321 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 AC008764.8-201ENST00000623966 2717 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 AL031432.4-201ENST00000641729 2190 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 SEC31A-205ENST00000395310 4259 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 SNX1-201ENST00000261889 3373 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 ZFYVE19-202ENST00000336455 1784 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 LYRM9-202ENST00000379103 1685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 ABCC4-206ENST00000536256 2840 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 STXBP1-202ENST00000373302 3967 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 SLC28A1-201ENST00000286749 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 PIGC-202ENST00000367728 2630 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 SLC35B3-201ENST00000379660 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 MME-204ENST00000462745 3590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms