Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJB2P29033 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJB2P29033 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJB2P29033 ZFYVE19-202ENST00000336455 1784 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJB2P29033 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJB2P29033 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJB2P29033 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJB2P29033 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJB2P29033 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJB2P29033 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJB2P29033 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GJB2P29033 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJB2P29033 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GJB2P29033 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJB2P29033 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJB2P29033 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJB2P29033 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJB2P29033 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJB2P29033 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJB2P29033 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJB2P29033 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJB2P29033 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJB2P29033 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJB2P29033 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJB2P29033 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GJB2P29033 EGLN3-205ENST00000547327 2849 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GJB2P29033 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJB2P29033 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJB2P29033 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJB2P29033 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJB2P29033 AC010547.1-201ENST00000500612 2793 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJB2P29033 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJB2P29033 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJB2P29033 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJB2P29033 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJB2P29033 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJB2P29033 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJB2P29033 IKZF1-206ENST00000359197 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJB2P29033 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GJB2P29033 ZNF239-205ENST00000535642 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJB2P29033 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJB2P29033 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJB2P29033 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GJB2P29033 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJB2P29033 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJB2P29033 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJB2P29033 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJB2P29033 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJB2P29033 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJB2P29033 METTL12-203ENST00000532971 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJB2P29033 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJB2P29033 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJB2P29033 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJB2P29033 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJB2P29033 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJB2P29033 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJB2P29033 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJB2P29033 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJB2P29033 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJB2P29033 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJB2P29033 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJB2P29033 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJB2P29033 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJB2P29033 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJB2P29033 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJB2P29033 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GJB2P29033 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJB2P29033 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJB2P29033 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJB2P29033 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJB2P29033 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJB2P29033 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJB2P29033 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJB2P29033 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GJB2P29033 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJB2P29033 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJB2P29033 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GJB2P29033 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJB2P29033 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJB2P29033 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJB2P29033 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJB2P29033 RSPO2-202ENST00000517781 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJB2P29033 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJB2P29033 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJB2P29033 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJB2P29033 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJB2P29033 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJB2P29033 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GJB2P29033 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJB2P29033 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJB2P29033 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJB2P29033 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJB2P29033 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJB2P29033 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJB2P29033 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJB2P29033 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJB2P29033 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJB2P29033 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJB2P29033 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJB2P29033 AC139795.2-201ENST00000499900 1751 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms