Protein–RNA interactions for Protein: P01374

LTA, Lymphotoxin-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTAP01374 VPS33B-202ENST00000535906 2420 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LTAP01374 INTS3-204ENST00000435409 3597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LTAP01374 KIR2DL3-201ENST00000342376 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LTAP01374 AC008764.8-201ENST00000623966 2717 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
LTAP01374 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LTAP01374 DHRS7B-202ENST00000395511 2175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LTAP01374 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LTAP01374 GATC-203ENST00000551765 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LTAP01374 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LTAP01374 CCNY-203ENST00000374704 3960 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LTAP01374 GLIS3-202ENST00000381971 3961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LTAP01374 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
LTAP01374 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LTAP01374 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LTAP01374 PGBD1-201ENST00000259883 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LTAP01374 GOSR2-233ENST00000640068 3103 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LTAP01374 PIP5K1A-204ENST00000409426 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LTAP01374 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LTAP01374 ZSCAN32-202ENST00000396846 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LTAP01374 PLA1A-206ENST00000495992 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LTAP01374 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LTAP01374 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LTAP01374 CAPN1-202ENST00000524773 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LTAP01374 SLC2A14-205ENST00000535295 1732 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LTAP01374 MKL1-210ENST00000614754 3917 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LTAP01374 EEF2KMT-201ENST00000427587 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LTAP01374 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LTAP01374 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
LTAP01374 SLC25A18-202ENST00000399813 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LTAP01374 AC091181.1-201ENST00000623762 2098 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
LTAP01374 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LTAP01374 CUL4A-203ENST00000375441 4037 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LTAP01374 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LTAP01374 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LTAP01374 HNRNPMP1-201ENST00000560685 1768 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
LTAP01374 FAM13B-203ENST00000425075 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LTAP01374 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LTAP01374 OXR1-202ENST00000312046 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LTAP01374 ZNF277-201ENST00000361822 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LTAP01374 DBF4B-202ENST00000393547 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LTAP01374 ZNF473-203ENST00000445728 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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LTAP01374 AC092028.1-201ENST00000641781 3540 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
LTAP01374 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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LTAP01374 PRTFDC1-201ENST00000320152 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LTAP01374 STAT3-202ENST00000389272 2615 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LTAP01374 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LTAP01374 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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LTAP01374 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LTAP01374 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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LTAP01374 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
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LTAP01374 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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LTAP01374 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
LTAP01374 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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LTAP01374 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LTAP01374 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LTAP01374 PAX8-203ENST00000348715 3966 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LTAP01374 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
LTAP01374 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LTAP01374 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LTAP01374 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LTAP01374 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LTAP01374 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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