Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 GFI1B-202ENST00000372122 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 LINC00675-202ENST00000581851 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 AL359979.2-201ENST00000435108 613 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 SMAD1-AS1-201ENST00000513542 481 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 SRPK2P-201ENST00000523408 1100 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 LINC02376-201ENST00000536330 724 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 LINC00969-253ENST00000625338 804 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 NR1H4-203ENST00000392986 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 CNGB1-202ENST00000311183 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 ATF3-202ENST00000341491 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 PPP2R2C-204ENST00000506140 1780 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 KRT8P25-201ENST00000473150 1456 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 MRPS12-202ENST00000402029 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 METTL7AP1-201ENST00000547343 496 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 BCDIN3D-AS1-202ENST00000549124 468 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 AL031705.1-201ENST00000566922 682 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 AC007998.2-201ENST00000589258 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 AC007193.3-201ENST00000598616 188 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 PACRG-AS3-203ENST00000614038 1246 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 ADH1B-207ENST00000639454 1210 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 MCF2L-209ENST00000397036 1544 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 THPO-203ENST00000445696 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 AC007336.3-201ENST00000623886 2160 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 ZSCAN5B-202ENST00000586855 2059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms