Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 MLF1-209ENST00000482628 1050 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 AC104758.3-203ENST00000562938 2123 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 PAX8-203ENST00000348715 3966 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 SEPT10-202ENST00000397712 3071 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 KLHL12-203ENST00000367261 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 ADAMTSL4-202ENST00000369038 4167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 ATG10-201ENST00000282185 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 PIK3R5-220ENST00000623421 4318 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 GPR55-205ENST00000622008 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 DYSF-206ENST00000409744 6564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 DYSF-209ENST00000410041 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 MST1R-201ENST00000296474 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 NR1D1-201ENST00000246672 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 ATG16L1-201ENST00000347464 2915 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 PES1-205ENST00000405677 2708 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 STXBP5L-201ENST00000273666 9496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 PALLD-209ENST00000507735 4379 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 PER1-211ENST00000581082 4521 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 CHD1L-202ENST00000369258 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 CLINT1-201ENST00000411809 3440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 CA14-201ENST00000369111 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 FAM198B-207ENST00000592057 3425 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms