Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 KIF17-202ENST00000375044 3572 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 AC244453.2-201ENST00000457996 3543 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 FAM13B-203ENST00000425075 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 HTR5A-201ENST00000287907 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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TRIM8Q9BZR9 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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TRIM8Q9BZR9 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
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TRIM8Q9BZR9 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 B4GALT4-201ENST00000359213 2385 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM8Q9BZR9 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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