Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 HJURP-204ENST00000432087 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 NANP-201ENST00000304788 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 MFAP3L-201ENST00000361618 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 ANGEL2-208ENST00000535388 2517 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 AL449403.1-201ENST00000432783 1577 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKRD34B-201ENST00000338682 3938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 ASB2-203ENST00000555019 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 NT5C3A-214ENST00000620705 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 MPP2-202ENST00000377184 4206 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 KC6-207ENST00000600644 2311 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 DCLK3-203ENST00000636136 5446 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 PLA2G4E-AS1-201ENST00000499478 2499 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 UBOX5-202ENST00000348031 4469 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC88A-214ENST00000621814 3089 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 AGPAT1-204ENST00000395496 2103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 AC008806.1-201ENST00000624962 2443 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC35A4-201ENST00000323146 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 GSN-205ENST00000373823 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 TBC1D16-202ENST00000340848 4244 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB43-203ENST00000393305 4215 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 TNC-203ENST00000423613 6281 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 MYO19-203ENST00000610930 3271 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 PID1-203ENST00000392055 2533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 AC099786.2-201ENST00000427892 2203 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 PHB-215ENST00000617874 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 PLEKHG5-203ENST00000377728 3613 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 ATXN10-201ENST00000252934 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 CYP11B1-204ENST00000517471 1874 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 STX16-205ENST00000361830 4318 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 MEG3-214ENST00000519709 1726 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 CHMP2B-201ENST00000263780 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 FLT4-202ENST00000393347 4292 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC27A6-203ENST00000506176 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 CEP41-201ENST00000223208 6513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 NFE2L1-222ENST00000585291 4390 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 CSTF2-201ENST00000372972 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 GOLGA8O-201ENST00000509311 1997 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 KLF4-206ENST00000610832 1956 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 ARMCX6-201ENST00000361910 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 PBOV1-201ENST00000527246 2506 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 2500 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 C5orf15-201ENST00000231512 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNB3-204ENST00000547230 2395 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM177A1-201ENST00000280987 2927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 SUCO-209ENST00000610051 2925 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 ZDHHC9-201ENST00000357166 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 CCBE1-202ENST00000439986 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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