Protein–RNA interactions for Protein: Q3YEC7

RABL6, Rab-like protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABL6Q3YEC7 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 PACRG-AS3-203ENST00000614038 1246 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 CRABP2-204ENST00000621784 1033 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 RBM25-204ENST00000526754 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 CLEC10A-202ENST00000416562 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 EGLN3-205ENST00000547327 2849 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 AC008040.5-201ENST00000599781 1781 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 AL357079.1-203ENST00000412378 494 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 LAMTOR4-202ENST00000441173 730 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 VDAC1P11-201ENST00000458323 852 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 AP003168.2-201ENST00000531215 471 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 AMHR2-204ENST00000550311 1787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 FCHO1-221ENST00000597512 2934 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 C1QTNF9-202ENST00000382071 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 MBOAT4-201ENST00000320542 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 LINC00675-202ENST00000581851 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 RMND5B-212ENST00000542098 1681 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 TMEM106A-201ENST00000536052 1181 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 METTL7AP1-201ENST00000547343 496 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 C19orf53-202ENST00000588234 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 AL590094.1-208ENST00000636917 627 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 MAGEC3-205ENST00000544766 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 MRRF-201ENST00000297908 1841 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 MEIS2-215ENST00000559561 1442 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RABL6Q3YEC7 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms