Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 ZNF816-208ENST00000535506 529 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TCOF1Q13428 AL162231.1-205ENST00000544078 338 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TCOF1Q13428 AL513478.2-202ENST00000621949 835 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TCOF1Q13428 AL590094.1-206ENST00000635959 478 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TCOF1Q13428 LINC00643-207ENST00000637212 734 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TCOF1Q13428 AL590094.1-209ENST00000637260 499 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TCOF1Q13428 AC006207.1-201ENST00000637958 562 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TCOF1Q13428 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TCOF1Q13428 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TCOF1Q13428 GLT6D1-201ENST00000371763 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TCOF1Q13428 GLT6D1-202ENST00000613244 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TCOF1Q13428 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TCOF1Q13428 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TCOF1Q13428 IP6K2-201ENST00000328631 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TCOF1Q13428 ADD1-207ENST00000446856 3745 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TCOF1Q13428 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TCOF1Q13428 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TCOF1Q13428 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TCOF1Q13428 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TCOF1Q13428 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TCOF1Q13428 EGLN3-205ENST00000547327 2849 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TCOF1Q13428 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TCOF1Q13428 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TCOF1Q13428 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TCOF1Q13428 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TCOF1Q13428 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TCOF1Q13428 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TCOF1Q13428 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TCOF1Q13428 AC008080.1-201ENST00000311067 1058 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TCOF1Q13428 TAC4-203ENST00000352793 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TCOF1Q13428 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TCOF1Q13428 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TCOF1Q13428 Z82185.1-201ENST00000417792 549 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TCOF1Q13428 BX088651.3-201ENST00000418155 352 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TCOF1Q13428 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TCOF1Q13428 TUBB8P5-201ENST00000445286 1351 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TCOF1Q13428 MARK2P17-201ENST00000498560 841 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TCOF1Q13428 AC092656.1-202ENST00000515843 998 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TCOF1Q13428 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TCOF1Q13428 C12orf73-204ENST00000546819 582 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TCOF1Q13428 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TCOF1Q13428 RN7SL524P-201ENST00000581152 300 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TCOF1Q13428 AC006262.2-202ENST00000600152 333 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TCOF1Q13428 OR5L1-201ENST00000625203 1110 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TCOF1Q13428 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TCOF1Q13428 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TCOF1Q13428 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TCOF1Q13428 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TCOF1Q13428 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TCOF1Q13428 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TCOF1Q13428 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TCOF1Q13428 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TCOF1Q13428 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TCOF1Q13428 PRDX1-202ENST00000319248 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TCOF1Q13428 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TCOF1Q13428 RBMXP1-201ENST00000408004 1191 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TCOF1Q13428 SUMO1-206ENST00000409368 1187 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TCOF1Q13428 AC231533.1-201ENST00000416061 925 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TCOF1Q13428 KRT18P44-201ENST00000416086 1285 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TCOF1Q13428 PEBP1P3-201ENST00000455475 548 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TCOF1Q13428 AC023051.2-201ENST00000541141 460 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TCOF1Q13428 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TCOF1Q13428 CBR3-AS1-206ENST00000608632 659 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TCOF1Q13428 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TCOF1Q13428 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TCOF1Q13428 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TCOF1Q13428 AKNA-203ENST00000312033 3334 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TCOF1Q13428 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TCOF1Q13428 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 HLA-DQA1-201ENST00000343139 1591 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 INCA1-201ENST00000355025 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 RPAIN-202ENST00000381208 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 DCAF13-201ENST00000297579 2642 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 ZCCHC7-201ENST00000322831 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 RNA5SP84-201ENST00000364740 107 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 TXLNGY-202ENST00000407724 1000 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 IP6K2-223ENST00000453202 571 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 AC011676.3-201ENST00000520606 294 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 AC090200.1-201ENST00000522918 590 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 AL513165.2-203ENST00000537239 717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 AL157871.1-201ENST00000555428 429 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 AC010478.1-203ENST00000558403 532 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 SRRM2-AS1-204ENST00000573802 818 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 FXYD3-206ENST00000603524 742 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 FXYD3-211ENST00000604804 564 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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