Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 LINC00969-231ENST00000597482 1476 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.1 ms