Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.6 ms