Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TMPOP42166 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TMPOP42166 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMPOP42166 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMPOP42166 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMPOP42166 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMPOP42166 ZNF384-204ENST00000396801 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMPOP42166 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMPOP42166 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMPOP42166 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMPOP42166 HTR4-203ENST00000377888 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMPOP42166 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMPOP42166 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TMPOP42166 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMPOP42166 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMPOP42166 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMPOP42166 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMPOP42166 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMPOP42166 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMPOP42166 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMPOP42166 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMPOP42166 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMPOP42166 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMPOP42166 EGLN3-205ENST00000547327 2849 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TMPOP42166 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMPOP42166 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMPOP42166 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMPOP42166 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMPOP42166 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMPOP42166 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMPOP42166 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMPOP42166 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMPOP42166 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMPOP42166 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMPOP42166 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TMPOP42166 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMPOP42166 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TMPOP42166 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMPOP42166 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMPOP42166 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMPOP42166 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMPOP42166 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMPOP42166 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TMPOP42166 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMPOP42166 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMPOP42166 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMPOP42166 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMPOP42166 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMPOP42166 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMPOP42166 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMPOP42166 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMPOP42166 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMPOP42166 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMPOP42166 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMPOP42166 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMPOP42166 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMPOP42166 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMPOP42166 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMPOP42166 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMPOP42166 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMPOP42166 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMPOP42166 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMPOP42166 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMPOP42166 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMPOP42166 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMPOP42166 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMPOP42166 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMPOP42166 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMPOP42166 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TMPOP42166 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TMPOP42166 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMPOP42166 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMPOP42166 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMPOP42166 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMPOP42166 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMPOP42166 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMPOP42166 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TMPOP42166 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TMPOP42166 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMPOP42166 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMPOP42166 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMPOP42166 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMPOP42166 THPO-203ENST00000445696 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMPOP42166 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMPOP42166 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMPOP42166 PPP2R2C-204ENST00000506140 1780 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMPOP42166 ATF3-202ENST00000341491 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMPOP42166 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMPOP42166 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMPOP42166 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMPOP42166 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMPOP42166 FAM86C1-202ENST00000359244 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMPOP42166 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMPOP42166 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMPOP42166 LINC01922-202ENST00000567168 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMPOP42166 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMPOP42166 KIR2DL3-201ENST00000342376 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMPOP42166 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TMPOP42166 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMPOP42166 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms