Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD8P13378 MKRN3-202ENST00000564592 629 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD8P13378 AC091304.3-201ENST00000566500 716 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HOXD8P13378 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD8P13378 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD8P13378 AC123912.6-201ENST00000612657 315 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HOXD8P13378 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD8P13378 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HOXD8P13378 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD8P13378 LTA-213ENST00000418386 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD8P13378 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD8P13378 CYP2B6-202ENST00000593831 1426 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD8P13378 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD8P13378 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD8P13378 ECI2-207ENST00000465828 1548 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD8P13378 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD8P13378 LINC01658-201ENST00000320372 1578 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD8P13378 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD8P13378 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD8P13378 GFI1B-202ENST00000372122 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD8P13378 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD8P13378 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD8P13378 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD8P13378 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD8P13378 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HOXD8P13378 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXD8P13378 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HOXD8P13378 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXD8P13378 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXD8P13378 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXD8P13378 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXD8P13378 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXD8P13378 GPATCH2L-202ENST00000312858 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HOXD8P13378 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC15.05■□□□□ 0
HOXD8P13378 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXD8P13378 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXD8P13378 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXD8P13378 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXD8P13378 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXD8P13378 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXD8P13378 TAC4-203ENST00000352793 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXD8P13378 TRPM3-205ENST00000361823 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXD8P13378 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXD8P13378 SNHG14-201ENST00000414175 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXD8P13378 HNRNPA1P10-201ENST00000444945 962 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HOXD8P13378 C14orf132-201ENST00000553764 562 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXD8P13378 SRP14-208ENST00000560773 468 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXD8P13378 BLVRB-202ENST00000595483 649 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXD8P13378 FAM90A28P-201ENST00000596881 489 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXD8P13378 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXD8P13378 Metazoa_SRP.63-201ENST00000617144 298 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HOXD8P13378 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXD8P13378 AC012358.2-201ENST00000430010 1434 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HOXD8P13378 CA6-205ENST00000480186 1493 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXD8P13378 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXD8P13378 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXD8P13378 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXD8P13378 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXD8P13378 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXD8P13378 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXD8P13378 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXD8P13378 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXD8P13378 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD8P13378 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD8P13378 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD8P13378 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD8P13378 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD8P13378 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD8P13378 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD8P13378 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD8P13378 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD8P13378 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD8P13378 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD8P13378 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD8P13378 CTRL-205ENST00000574481 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD8P13378 THPO-203ENST00000445696 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD8P13378 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD8P13378 NAAA-203ENST00000505594 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD8P13378 LINC02433-202ENST00000507108 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD8P13378 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD8P13378 AC008038.1-201ENST00000634247 1314 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HOXD8P13378 SLC25A5-201ENST00000317881 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD8P13378 VASH2-205ENST00000366967 1206 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD8P13378 AL359649.1-202ENST00000375713 443 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD8P13378 MIR632-201ENST00000385193 94 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HOXD8P13378 KRTAP2-3-201ENST00000391418 875 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD8P13378 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD8P13378 AC004969.1-201ENST00000471553 578 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD8P13378 RPSAP70-201ENST00000504462 864 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HOXD8P13378 AC023051.2-201ENST00000541141 460 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HOXD8P13378 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD8P13378 GRAMD4P6-201ENST00000556999 244 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HOXD8P13378 AC105133.1-201ENST00000559749 742 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD8P13378 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HOXD8P13378 CCND3P2-201ENST00000579393 537 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HOXD8P13378 ZNF724-202ENST00000597037 780 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD8P13378 AC211476.2-201ENST00000608799 708 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HOXD8P13378 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD8P13378 LINC02498-201ENST00000635390 1065 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD8P13378 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms