Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 ECI2-202ENST00000380118 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 SETMAR-205ENST00000425863 1657 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 ZFYVE19-215ENST00000570108 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 AC139795.2-201ENST00000499900 1751 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 Z82195.2-202ENST00000458525 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 SLC38A5-210ENST00000595796 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 SNU13-204ENST00000402458 462 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 ELFN1-AS1-201ENST00000415399 636 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 RPL15-205ENST00000415719 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms