Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K3

ACTR3C, Actin-related protein 3C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3CQ9C0K3 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 DACH2-201ENST00000373125 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 ARPP21-213ENST00000428373 3150 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 ATXN2L-201ENST00000325215 3788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 AC010969.2-201ENST00000602458 3231 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 HERC2P9-206ENST00000529624 5187 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 ELP2-221ENST00000542824 2288 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 NAV2-204ENST00000396087 7882 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 GTF2F1-201ENST00000394456 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 SLC13A4-201ENST00000354042 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 PARP10-203ENST00000524918 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 KRT15-202ENST00000393974 3758 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 PCSK2-202ENST00000377899 4674 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 TBL1X-202ENST00000380961 4674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 DPYSL5-207ENST00000614712 5128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 FAM102A-202ENST00000373084 3352 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 SYTL4-201ENST00000263033 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 GEMIN5-201ENST00000285873 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 NDRG4-201ENST00000258187 3324 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 ARSG-201ENST00000448504 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 RASA4CP-203ENST00000446874 3193 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 DCAF5-209ENST00000557386 2883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 NOA1-201ENST00000264230 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 RNF219-AS1-209ENST00000606429 2418 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 SLC25A24-203ENST00000565488 4271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 TLE3-208ENST00000557907 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 TMX1-201ENST00000457354 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 IL21R-201ENST00000337929 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 NPLOC4-202ENST00000374747 5538 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 CARD14-209ENST00000573882 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 EXOC7-216ENST00000589210 4751 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 NEK3-205ENST00000610828 2396 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 HERC6-202ENST00000273960 3473 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 EPM2A-207ENST00000611340 2786 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 NR1H3-201ENST00000395397 1501 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 RFX5-202ENST00000368870 2459 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 LITAF-221ENST00000622633 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 SLC6A1-201ENST00000287766 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 KDM6A-214ENST00000621147 2876 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 CEP68-201ENST00000260569 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 LINC00343-203ENST00000454555 1765 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 KIF9-208ENST00000452770 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 BAIAP2-AS1-202ENST00000577066 4465 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 PRRC2A-202ENST00000376033 6893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms