Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 B4GALT4-201ENST00000359213 2385 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 DDX50-201ENST00000373585 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 ZCCHC12-201ENST00000310164 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.7 ms