Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 VDAC1P11-201ENST00000458323 852 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 AL139316.1-201ENST00000555643 568 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 KRT37-201ENST00000225550 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 ATP6V1C1-205ENST00000521514 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 MAGEC3-205ENST00000544766 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 RPL29P2-202ENST00000498671 657 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 AL031705.1-201ENST00000566922 682 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 AC007193.3-201ENST00000598616 188 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.3 ms