Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC12.14□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms