Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 PPT1-204ENST00000439754 2195 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 ZFYVE27-205ENST00000370613 2669 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 IL12RB1-207ENST00000600835 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 MDH2-203ENST00000432020 1548 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 RBM15-204ENST00000617047 3284 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 AC008040.5-201ENST00000599781 1781 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 CCNY-203ENST00000374704 3960 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 LYRM9-202ENST00000379103 1685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 ZNF384-204ENST00000396801 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 ZNF410-201ENST00000324593 2293 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 GATC-203ENST00000551765 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 STAT3-203ENST00000404395 2633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 KCNT1-213ENST00000630792 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 IKBKB-218ENST00000520835 2403 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 TXNDC17-201ENST00000250101 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 ZNF124-202ENST00000472531 2243 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 PPP1R8-203ENST00000373931 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 DPP8-201ENST00000300141 3139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 LILRB1-203ENST00000396317 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms