Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK8P49336 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK8P49336 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK8P49336 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK8P49336 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK8P49336 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK8P49336 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK8P49336 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK8P49336 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK8P49336 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK8P49336 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK8P49336 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK8P49336 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK8P49336 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK8P49336 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK8P49336 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK8P49336 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK8P49336 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK8P49336 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK8P49336 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK8P49336 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK8P49336 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK8P49336 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK8P49336 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK8P49336 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK8P49336 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK8P49336 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK8P49336 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK8P49336 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK8P49336 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK8P49336 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK8P49336 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK8P49336 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK8P49336 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK8P49336 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK8P49336 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK8P49336 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK8P49336 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK8P49336 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK8P49336 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK8P49336 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK8P49336 LINC01922-202ENST00000567168 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK8P49336 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK8P49336 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK8P49336 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK8P49336 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK8P49336 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK8P49336 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK8P49336 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK8P49336 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK8P49336 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK8P49336 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK8P49336 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK8P49336 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK8P49336 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK8P49336 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK8P49336 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK8P49336 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK8P49336 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK8P49336 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK8P49336 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK8P49336 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK8P49336 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK8P49336 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK8P49336 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK8P49336 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK8P49336 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK8P49336 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK8P49336 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK8P49336 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK8P49336 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK8P49336 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK8P49336 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK8P49336 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK8P49336 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK8P49336 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK8P49336 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK8P49336 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK8P49336 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK8P49336 FAM153C-201ENST00000398106 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK8P49336 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK8P49336 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK8P49336 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK8P49336 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK8P49336 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK8P49336 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK8P49336 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK8P49336 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK8P49336 SETMAR-205ENST00000425863 1657 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK8P49336 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK8P49336 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK8P49336 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK8P49336 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK8P49336 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK8P49336 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK8P49336 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK8P49336 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK8P49336 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK8P49336 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK8P49336 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms