Protein–RNA interactions for Protein: P21291

CSRP1, Cysteine and glycine-rich protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP1P21291 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 SPAG1-205ENST00000520508 1796 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 GTF2A1L-201ENST00000403751 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 AL137077.2-201ENST00000635124 1608 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 EXOSC7-201ENST00000265564 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 CSRP2-201ENST00000311083 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 AC068631.1-228ENST00000354642 742 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 FTHL17-201ENST00000359202 813 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 CHEK2-203ENST00000382565 696 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 FOLR1-204ENST00000393681 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 DNM1P46-202ENST00000415963 882 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 AC007383.2-201ENST00000420509 752 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 GHRL-206ENST00000430179 856 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 AC103563.2-201ENST00000442200 597 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 OR52V1P-201ENST00000515557 898 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 OR4A49P-201ENST00000527050 632 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 TBX5-AS1-202ENST00000531024 766 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 AP003785.1-201ENST00000544959 492 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 CSRP2-203ENST00000547435 632 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 DLX6-203ENST00000555308 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 HNRNPC-221ENST00000555883 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 MT1X-202ENST00000562939 538 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 AC026461.1-201ENST00000567563 551 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 ANAPC11-214ENST00000578544 403 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 HCG18-241ENST00000602290 821 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 RPL4P6-201ENST00000438116 1304 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 TTN-AS1-264ENST00000627564 1319 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 RFPL3-201ENST00000249007 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 MCOLN3-201ENST00000341115 1762 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 IZUMO1R-201ENST00000328458 798 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 KRTAP1-5-201ENST00000361883 1177 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 SH3BGR-202ENST00000380631 780 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 ACOT6-201ENST00000381139 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 POLR2LP1-206ENST00000444785 187 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 PRSS46-201ENST00000463091 982 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 TMA16-204ENST00000508268 608 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 RNA5SP420-201ENST00000516997 137 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 AL157871.1-201ENST00000555428 429 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 TPST2P1-201ENST00000564073 1102 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 CARHSP1-208ENST00000567554 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CSRP1P21291 PCTP-206ENST00000573500 919 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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