Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 UNC13B-206ENST00000617908 6432 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 UNC13B-207ENST00000619578 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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SCN2BO60939 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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SCN2BO60939 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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SCN2BO60939 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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SCN2BO60939 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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SCN2BO60939 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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SCN2BO60939 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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SCN2BO60939 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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