Protein–RNA interactions for Protein: R4GNA1

MINOS1-NBL1, MICOS complex subunit MIC10 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINOS1-NBL1R4GNA1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MINOS1-NBL1R4GNA1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MINOS1-NBL1R4GNA1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MINOS1-NBL1R4GNA1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MINOS1-NBL1R4GNA1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MINOS1-NBL1R4GNA1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
MINOS1-NBL1R4GNA1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MINOS1-NBL1R4GNA1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MINOS1-NBL1R4GNA1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MINOS1-NBL1R4GNA1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MINOS1-NBL1R4GNA1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MINOS1-NBL1R4GNA1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MINOS1-NBL1R4GNA1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MINOS1-NBL1R4GNA1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms