Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D9

MAD1L1, Mitotic spindle assembly checkpoint protein MAD1, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAD1L1Q9Y6D9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MAD1L1Q9Y6D9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MAD1L1Q9Y6D9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MAD1L1Q9Y6D9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MAD1L1Q9Y6D9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MAD1L1Q9Y6D9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MAD1L1Q9Y6D9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MAD1L1Q9Y6D9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MAD1L1Q9Y6D9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MAD1L1Q9Y6D9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MAD1L1Q9Y6D9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MAD1L1Q9Y6D9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MAD1L1Q9Y6D9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAD1L1Q9Y6D9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAD1L1Q9Y6D9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAD1L1Q9Y6D9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAD1L1Q9Y6D9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAD1L1Q9Y6D9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAD1L1Q9Y6D9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAD1L1Q9Y6D9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAD1L1Q9Y6D9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAD1L1Q9Y6D9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAD1L1Q9Y6D9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAD1L1Q9Y6D9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAD1L1Q9Y6D9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAD1L1Q9Y6D9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAD1L1Q9Y6D9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAD1L1Q9Y6D9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAD1L1Q9Y6D9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAD1L1Q9Y6D9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAD1L1Q9Y6D9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAD1L1Q9Y6D9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAD1L1Q9Y6D9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAD1L1Q9Y6D9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAD1L1Q9Y6D9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAD1L1Q9Y6D9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MAD1L1Q9Y6D9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAD1L1Q9Y6D9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAD1L1Q9Y6D9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAD1L1Q9Y6D9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAD1L1Q9Y6D9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAD1L1Q9Y6D9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAD1L1Q9Y6D9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAD1L1Q9Y6D9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAD1L1Q9Y6D9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAD1L1Q9Y6D9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAD1L1Q9Y6D9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAD1L1Q9Y6D9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAD1L1Q9Y6D9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAD1L1Q9Y6D9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAD1L1Q9Y6D9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAD1L1Q9Y6D9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAD1L1Q9Y6D9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAD1L1Q9Y6D9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAD1L1Q9Y6D9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MAD1L1Q9Y6D9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAD1L1Q9Y6D9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAD1L1Q9Y6D9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAD1L1Q9Y6D9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAD1L1Q9Y6D9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAD1L1Q9Y6D9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAD1L1Q9Y6D9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAD1L1Q9Y6D9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAD1L1Q9Y6D9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAD1L1Q9Y6D9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAD1L1Q9Y6D9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAD1L1Q9Y6D9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAD1L1Q9Y6D9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAD1L1Q9Y6D9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAD1L1Q9Y6D9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAD1L1Q9Y6D9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAD1L1Q9Y6D9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAD1L1Q9Y6D9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MAD1L1Q9Y6D9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAD1L1Q9Y6D9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAD1L1Q9Y6D9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAD1L1Q9Y6D9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAD1L1Q9Y6D9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAD1L1Q9Y6D9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAD1L1Q9Y6D9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAD1L1Q9Y6D9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAD1L1Q9Y6D9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAD1L1Q9Y6D9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MAD1L1Q9Y6D9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAD1L1Q9Y6D9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAD1L1Q9Y6D9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAD1L1Q9Y6D9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAD1L1Q9Y6D9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAD1L1Q9Y6D9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAD1L1Q9Y6D9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAD1L1Q9Y6D9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAD1L1Q9Y6D9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAD1L1Q9Y6D9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAD1L1Q9Y6D9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAD1L1Q9Y6D9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAD1L1Q9Y6D9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAD1L1Q9Y6D9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAD1L1Q9Y6D9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAD1L1Q9Y6D9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAD1L1Q9Y6D9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms