Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3S2

ZNF330, Zinc finger protein 330, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF330Q9Y3S2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZNF330Q9Y3S2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZNF330Q9Y3S2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZNF330Q9Y3S2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
ZNF330Q9Y3S2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZNF330Q9Y3S2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZNF330Q9Y3S2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZNF330Q9Y3S2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZNF330Q9Y3S2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZNF330Q9Y3S2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZNF330Q9Y3S2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZNF330Q9Y3S2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZNF330Q9Y3S2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZNF330Q9Y3S2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZNF330Q9Y3S2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZNF330Q9Y3S2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZNF330Q9Y3S2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
ZNF330Q9Y3S2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZNF330Q9Y3S2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZNF330Q9Y3S2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZNF330Q9Y3S2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZNF330Q9Y3S2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZNF330Q9Y3S2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZNF330Q9Y3S2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZNF330Q9Y3S2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZNF330Q9Y3S2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
ZNF330Q9Y3S2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZNF330Q9Y3S2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZNF330Q9Y3S2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
ZNF330Q9Y3S2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZNF330Q9Y3S2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZNF330Q9Y3S2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZNF330Q9Y3S2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZNF330Q9Y3S2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZNF330Q9Y3S2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZNF330Q9Y3S2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZNF330Q9Y3S2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZNF330Q9Y3S2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
ZNF330Q9Y3S2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZNF330Q9Y3S2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZNF330Q9Y3S2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZNF330Q9Y3S2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZNF330Q9Y3S2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZNF330Q9Y3S2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZNF330Q9Y3S2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZNF330Q9Y3S2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZNF330Q9Y3S2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
ZNF330Q9Y3S2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZNF330Q9Y3S2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZNF330Q9Y3S2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
ZNF330Q9Y3S2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
ZNF330Q9Y3S2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
ZNF330Q9Y3S2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
ZNF330Q9Y3S2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
ZNF330Q9Y3S2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
ZNF330Q9Y3S2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZNF330Q9Y3S2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZNF330Q9Y3S2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZNF330Q9Y3S2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZNF330Q9Y3S2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZNF330Q9Y3S2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZNF330Q9Y3S2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZNF330Q9Y3S2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZNF330Q9Y3S2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZNF330Q9Y3S2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZNF330Q9Y3S2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZNF330Q9Y3S2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZNF330Q9Y3S2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZNF330Q9Y3S2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZNF330Q9Y3S2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZNF330Q9Y3S2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZNF330Q9Y3S2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZNF330Q9Y3S2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZNF330Q9Y3S2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZNF330Q9Y3S2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZNF330Q9Y3S2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZNF330Q9Y3S2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZNF330Q9Y3S2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZNF330Q9Y3S2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZNF330Q9Y3S2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZNF330Q9Y3S2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZNF330Q9Y3S2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZNF330Q9Y3S2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZNF330Q9Y3S2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZNF330Q9Y3S2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
ZNF330Q9Y3S2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZNF330Q9Y3S2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZNF330Q9Y3S2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZNF330Q9Y3S2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZNF330Q9Y3S2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
ZNF330Q9Y3S2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
ZNF330Q9Y3S2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
ZNF330Q9Y3S2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZNF330Q9Y3S2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZNF330Q9Y3S2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZNF330Q9Y3S2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZNF330Q9Y3S2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZNF330Q9Y3S2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZNF330Q9Y3S2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZNF330Q9Y3S2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms