Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQR0

SCML2, Sex comb on midleg-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML2Q9UQR0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCML2Q9UQR0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCML2Q9UQR0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCML2Q9UQR0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SCML2Q9UQR0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCML2Q9UQR0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCML2Q9UQR0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCML2Q9UQR0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCML2Q9UQR0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SCML2Q9UQR0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SCML2Q9UQR0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCML2Q9UQR0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCML2Q9UQR0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCML2Q9UQR0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCML2Q9UQR0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCML2Q9UQR0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCML2Q9UQR0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCML2Q9UQR0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCML2Q9UQR0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCML2Q9UQR0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCML2Q9UQR0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SCML2Q9UQR0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCML2Q9UQR0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCML2Q9UQR0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCML2Q9UQR0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCML2Q9UQR0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCML2Q9UQR0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCML2Q9UQR0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCML2Q9UQR0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCML2Q9UQR0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCML2Q9UQR0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCML2Q9UQR0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCML2Q9UQR0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCML2Q9UQR0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCML2Q9UQR0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCML2Q9UQR0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCML2Q9UQR0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCML2Q9UQR0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCML2Q9UQR0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCML2Q9UQR0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCML2Q9UQR0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCML2Q9UQR0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCML2Q9UQR0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCML2Q9UQR0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCML2Q9UQR0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCML2Q9UQR0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCML2Q9UQR0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCML2Q9UQR0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCML2Q9UQR0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCML2Q9UQR0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SCML2Q9UQR0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SCML2Q9UQR0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCML2Q9UQR0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCML2Q9UQR0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCML2Q9UQR0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCML2Q9UQR0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCML2Q9UQR0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCML2Q9UQR0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCML2Q9UQR0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SCML2Q9UQR0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCML2Q9UQR0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCML2Q9UQR0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCML2Q9UQR0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCML2Q9UQR0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCML2Q9UQR0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SCML2Q9UQR0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCML2Q9UQR0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCML2Q9UQR0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCML2Q9UQR0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCML2Q9UQR0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCML2Q9UQR0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCML2Q9UQR0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SCML2Q9UQR0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCML2Q9UQR0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCML2Q9UQR0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCML2Q9UQR0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCML2Q9UQR0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SCML2Q9UQR0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCML2Q9UQR0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCML2Q9UQR0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCML2Q9UQR0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SCML2Q9UQR0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCML2Q9UQR0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCML2Q9UQR0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCML2Q9UQR0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCML2Q9UQR0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCML2Q9UQR0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCML2Q9UQR0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCML2Q9UQR0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCML2Q9UQR0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCML2Q9UQR0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCML2Q9UQR0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCML2Q9UQR0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCML2Q9UQR0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCML2Q9UQR0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCML2Q9UQR0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCML2Q9UQR0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCML2Q9UQR0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCML2Q9UQR0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCML2Q9UQR0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms