Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM22

EPDR1, Mammalian ependymin-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPDR1Q9UM22 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EPDR1Q9UM22 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EPDR1Q9UM22 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EPDR1Q9UM22 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EPDR1Q9UM22 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EPDR1Q9UM22 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EPDR1Q9UM22 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EPDR1Q9UM22 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EPDR1Q9UM22 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EPDR1Q9UM22 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
EPDR1Q9UM22 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EPDR1Q9UM22 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EPDR1Q9UM22 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EPDR1Q9UM22 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EPDR1Q9UM22 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EPDR1Q9UM22 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EPDR1Q9UM22 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
EPDR1Q9UM22 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EPDR1Q9UM22 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EPDR1Q9UM22 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EPDR1Q9UM22 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EPDR1Q9UM22 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EPDR1Q9UM22 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EPDR1Q9UM22 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPDR1Q9UM22 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPDR1Q9UM22 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
EPDR1Q9UM22 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPDR1Q9UM22 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPDR1Q9UM22 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
EPDR1Q9UM22 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPDR1Q9UM22 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPDR1Q9UM22 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPDR1Q9UM22 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPDR1Q9UM22 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPDR1Q9UM22 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPDR1Q9UM22 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPDR1Q9UM22 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EPDR1Q9UM22 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
EPDR1Q9UM22 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms