Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNRF3Q9ULT6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNRF3Q9ULT6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNRF3Q9ULT6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNRF3Q9ULT6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNRF3Q9ULT6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNRF3Q9ULT6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNRF3Q9ULT6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNRF3Q9ULT6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNRF3Q9ULT6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNRF3Q9ULT6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNRF3Q9ULT6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNRF3Q9ULT6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNRF3Q9ULT6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNRF3Q9ULT6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNRF3Q9ULT6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNRF3Q9ULT6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNRF3Q9ULT6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNRF3Q9ULT6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNRF3Q9ULT6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNRF3Q9ULT6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNRF3Q9ULT6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNRF3Q9ULT6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNRF3Q9ULT6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNRF3Q9ULT6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNRF3Q9ULT6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNRF3Q9ULT6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNRF3Q9ULT6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNRF3Q9ULT6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNRF3Q9ULT6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNRF3Q9ULT6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNRF3Q9ULT6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNRF3Q9ULT6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNRF3Q9ULT6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNRF3Q9ULT6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNRF3Q9ULT6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNRF3Q9ULT6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.96
ZNRF3Q9ULT6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNRF3Q9ULT6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNRF3Q9ULT6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNRF3Q9ULT6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNRF3Q9ULT6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNRF3Q9ULT6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNRF3Q9ULT6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNRF3Q9ULT6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNRF3Q9ULT6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNRF3Q9ULT6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNRF3Q9ULT6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNRF3Q9ULT6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNRF3Q9ULT6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNRF3Q9ULT6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNRF3Q9ULT6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNRF3Q9ULT6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNRF3Q9ULT6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNRF3Q9ULT6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNRF3Q9ULT6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNRF3Q9ULT6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNRF3Q9ULT6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNRF3Q9ULT6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNRF3Q9ULT6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNRF3Q9ULT6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNRF3Q9ULT6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNRF3Q9ULT6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNRF3Q9ULT6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNRF3Q9ULT6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNRF3Q9ULT6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNRF3Q9ULT6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNRF3Q9ULT6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNRF3Q9ULT6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNRF3Q9ULT6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNRF3Q9ULT6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNRF3Q9ULT6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNRF3Q9ULT6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNRF3Q9ULT6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNRF3Q9ULT6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNRF3Q9ULT6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNRF3Q9ULT6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNRF3Q9ULT6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNRF3Q9ULT6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNRF3Q9ULT6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNRF3Q9ULT6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNRF3Q9ULT6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNRF3Q9ULT6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNRF3Q9ULT6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNRF3Q9ULT6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNRF3Q9ULT6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNRF3Q9ULT6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNRF3Q9ULT6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNRF3Q9ULT6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNRF3Q9ULT6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNRF3Q9ULT6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNRF3Q9ULT6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNRF3Q9ULT6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ZNRF3Q9ULT6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ZNRF3Q9ULT6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNRF3Q9ULT6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNRF3Q9ULT6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNRF3Q9ULT6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNRF3Q9ULT6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNRF3Q9ULT6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms