Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULI2

RIMKLB, Beta-citrylglutamate synthase B, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMKLBQ9ULI2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIMKLBQ9ULI2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIMKLBQ9ULI2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIMKLBQ9ULI2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIMKLBQ9ULI2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIMKLBQ9ULI2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIMKLBQ9ULI2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIMKLBQ9ULI2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIMKLBQ9ULI2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIMKLBQ9ULI2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIMKLBQ9ULI2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIMKLBQ9ULI2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIMKLBQ9ULI2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIMKLBQ9ULI2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIMKLBQ9ULI2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIMKLBQ9ULI2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIMKLBQ9ULI2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIMKLBQ9ULI2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RIMKLBQ9ULI2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RIMKLBQ9ULI2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIMKLBQ9ULI2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIMKLBQ9ULI2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIMKLBQ9ULI2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIMKLBQ9ULI2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RIMKLBQ9ULI2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RIMKLBQ9ULI2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RIMKLBQ9ULI2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RIMKLBQ9ULI2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RIMKLBQ9ULI2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RIMKLBQ9ULI2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RIMKLBQ9ULI2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RIMKLBQ9ULI2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RIMKLBQ9ULI2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RIMKLBQ9ULI2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIMKLBQ9ULI2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIMKLBQ9ULI2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIMKLBQ9ULI2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIMKLBQ9ULI2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIMKLBQ9ULI2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIMKLBQ9ULI2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIMKLBQ9ULI2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIMKLBQ9ULI2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RIMKLBQ9ULI2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RIMKLBQ9ULI2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RIMKLBQ9ULI2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RIMKLBQ9ULI2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RIMKLBQ9ULI2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RIMKLBQ9ULI2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RIMKLBQ9ULI2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RIMKLBQ9ULI2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RIMKLBQ9ULI2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RIMKLBQ9ULI2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RIMKLBQ9ULI2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIMKLBQ9ULI2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIMKLBQ9ULI2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIMKLBQ9ULI2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIMKLBQ9ULI2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIMKLBQ9ULI2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIMKLBQ9ULI2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIMKLBQ9ULI2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIMKLBQ9ULI2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIMKLBQ9ULI2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIMKLBQ9ULI2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIMKLBQ9ULI2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIMKLBQ9ULI2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIMKLBQ9ULI2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIMKLBQ9ULI2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIMKLBQ9ULI2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIMKLBQ9ULI2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIMKLBQ9ULI2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIMKLBQ9ULI2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIMKLBQ9ULI2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIMKLBQ9ULI2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIMKLBQ9ULI2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIMKLBQ9ULI2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIMKLBQ9ULI2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIMKLBQ9ULI2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIMKLBQ9ULI2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIMKLBQ9ULI2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIMKLBQ9ULI2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RIMKLBQ9ULI2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIMKLBQ9ULI2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIMKLBQ9ULI2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIMKLBQ9ULI2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIMKLBQ9ULI2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIMKLBQ9ULI2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RIMKLBQ9ULI2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIMKLBQ9ULI2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIMKLBQ9ULI2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIMKLBQ9ULI2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIMKLBQ9ULI2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIMKLBQ9ULI2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIMKLBQ9ULI2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIMKLBQ9ULI2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIMKLBQ9ULI2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIMKLBQ9ULI2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIMKLBQ9ULI2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RIMKLBQ9ULI2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIMKLBQ9ULI2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIMKLBQ9ULI2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms