Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
INO80Q9ULG1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
INO80Q9ULG1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC33.82■■■■□ 3
INO80Q9ULG1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC33.82■■■■□ 3
INO80Q9ULG1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
INO80Q9ULG1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
INO80Q9ULG1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
INO80Q9ULG1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC33.81■■■■□ 3
INO80Q9ULG1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC33.81■■■■□ 3
INO80Q9ULG1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
INO80Q9ULG1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
INO80Q9ULG1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
INO80Q9ULG1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
INO80Q9ULG1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
INO80Q9ULG1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
INO80Q9ULG1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
INO80Q9ULG1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
INO80Q9ULG1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
INO80Q9ULG1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
INO80Q9ULG1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
INO80Q9ULG1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
INO80Q9ULG1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
INO80Q9ULG1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC33.81■■■■□ 3
INO80Q9ULG1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
INO80Q9ULG1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC33.81■■■■□ 3
INO80Q9ULG1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
INO80Q9ULG1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
INO80Q9ULG1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
INO80Q9ULG1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
INO80Q9ULG1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
INO80Q9ULG1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
INO80Q9ULG1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
INO80Q9ULG1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
INO80Q9ULG1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
INO80Q9ULG1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
INO80Q9ULG1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC33.79■■■■□ 3
INO80Q9ULG1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
INO80Q9ULG1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
INO80Q9ULG1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
INO80Q9ULG1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
INO80Q9ULG1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
INO80Q9ULG1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
INO80Q9ULG1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC33.78■■■■□ 3
INO80Q9ULG1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC33.78■■■■□ 3
INO80Q9ULG1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
INO80Q9ULG1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
INO80Q9ULG1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
INO80Q9ULG1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC33.77■■■■□ 3
INO80Q9ULG1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
INO80Q9ULG1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
INO80Q9ULG1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
INO80Q9ULG1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
INO80Q9ULG1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■□□ 2.99
INO80Q9ULG1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
INO80Q9ULG1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
INO80Q9ULG1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
INO80Q9ULG1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
INO80Q9ULG1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
INO80Q9ULG1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
INO80Q9ULG1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
INO80Q9ULG1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC33.75■■■□□ 2.99
INO80Q9ULG1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
INO80Q9ULG1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
INO80Q9ULG1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
INO80Q9ULG1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
INO80Q9ULG1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
INO80Q9ULG1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
INO80Q9ULG1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
INO80Q9ULG1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
INO80Q9ULG1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
INO80Q9ULG1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC33.74■■■□□ 2.99
INO80Q9ULG1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC33.74■■■□□ 2.99
INO80Q9ULG1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
INO80Q9ULG1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
INO80Q9ULG1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
INO80Q9ULG1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
INO80Q9ULG1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
INO80Q9ULG1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
INO80Q9ULG1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
INO80Q9ULG1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
INO80Q9ULG1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
INO80Q9ULG1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
INO80Q9ULG1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
INO80Q9ULG1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
INO80Q9ULG1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
INO80Q9ULG1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
INO80Q9ULG1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
INO80Q9ULG1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
INO80Q9ULG1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
INO80Q9ULG1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
INO80Q9ULG1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
INO80Q9ULG1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
INO80Q9ULG1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
INO80Q9ULG1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
INO80Q9ULG1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
INO80Q9ULG1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
INO80Q9ULG1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
INO80Q9ULG1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
INO80Q9ULG1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
INO80Q9ULG1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms