Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB23Q9ULC3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB23Q9ULC3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB23Q9ULC3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB23Q9ULC3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB23Q9ULC3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB23Q9ULC3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB23Q9ULC3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB23Q9ULC3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB23Q9ULC3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB23Q9ULC3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB23Q9ULC3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB23Q9ULC3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB23Q9ULC3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB23Q9ULC3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB23Q9ULC3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB23Q9ULC3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB23Q9ULC3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB23Q9ULC3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB23Q9ULC3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB23Q9ULC3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB23Q9ULC3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB23Q9ULC3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB23Q9ULC3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB23Q9ULC3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB23Q9ULC3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB23Q9ULC3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB23Q9ULC3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB23Q9ULC3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB23Q9ULC3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAB23Q9ULC3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAB23Q9ULC3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB23Q9ULC3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB23Q9ULC3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB23Q9ULC3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB23Q9ULC3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB23Q9ULC3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB23Q9ULC3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB23Q9ULC3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB23Q9ULC3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB23Q9ULC3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB23Q9ULC3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB23Q9ULC3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB23Q9ULC3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB23Q9ULC3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB23Q9ULC3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB23Q9ULC3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB23Q9ULC3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB23Q9ULC3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB23Q9ULC3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB23Q9ULC3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB23Q9ULC3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB23Q9ULC3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB23Q9ULC3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB23Q9ULC3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB23Q9ULC3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB23Q9ULC3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB23Q9ULC3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB23Q9ULC3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB23Q9ULC3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB23Q9ULC3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB23Q9ULC3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB23Q9ULC3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB23Q9ULC3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB23Q9ULC3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB23Q9ULC3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB23Q9ULC3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB23Q9ULC3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB23Q9ULC3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB23Q9ULC3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB23Q9ULC3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB23Q9ULC3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB23Q9ULC3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB23Q9ULC3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB23Q9ULC3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB23Q9ULC3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB23Q9ULC3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB23Q9ULC3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB23Q9ULC3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB23Q9ULC3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB23Q9ULC3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB23Q9ULC3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB23Q9ULC3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB23Q9ULC3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB23Q9ULC3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB23Q9ULC3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB23Q9ULC3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB23Q9ULC3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB23Q9ULC3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB23Q9ULC3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB23Q9ULC3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB23Q9ULC3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB23Q9ULC3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB23Q9ULC3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB23Q9ULC3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB23Q9ULC3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB23Q9ULC3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB23Q9ULC3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB23Q9ULC3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB23Q9ULC3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms