Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJD2Q9UKL4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJD2Q9UKL4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJD2Q9UKL4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJD2Q9UKL4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJD2Q9UKL4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJD2Q9UKL4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJD2Q9UKL4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJD2Q9UKL4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJD2Q9UKL4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJD2Q9UKL4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJD2Q9UKL4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJD2Q9UKL4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJD2Q9UKL4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJD2Q9UKL4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJD2Q9UKL4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJD2Q9UKL4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJD2Q9UKL4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJD2Q9UKL4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJD2Q9UKL4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJD2Q9UKL4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJD2Q9UKL4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJD2Q9UKL4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GJD2Q9UKL4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJD2Q9UKL4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJD2Q9UKL4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJD2Q9UKL4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJD2Q9UKL4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJD2Q9UKL4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJD2Q9UKL4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJD2Q9UKL4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJD2Q9UKL4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJD2Q9UKL4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJD2Q9UKL4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJD2Q9UKL4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJD2Q9UKL4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJD2Q9UKL4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJD2Q9UKL4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJD2Q9UKL4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJD2Q9UKL4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
GJD2Q9UKL4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJD2Q9UKL4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJD2Q9UKL4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJD2Q9UKL4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJD2Q9UKL4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJD2Q9UKL4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJD2Q9UKL4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
GJD2Q9UKL4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJD2Q9UKL4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GJD2Q9UKL4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GJD2Q9UKL4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GJD2Q9UKL4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GJD2Q9UKL4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GJD2Q9UKL4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GJD2Q9UKL4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GJD2Q9UKL4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GJD2Q9UKL4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GJD2Q9UKL4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GJD2Q9UKL4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
GJD2Q9UKL4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJD2Q9UKL4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJD2Q9UKL4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJD2Q9UKL4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJD2Q9UKL4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJD2Q9UKL4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJD2Q9UKL4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJD2Q9UKL4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJD2Q9UKL4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJD2Q9UKL4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJD2Q9UKL4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJD2Q9UKL4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJD2Q9UKL4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJD2Q9UKL4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJD2Q9UKL4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
GJD2Q9UKL4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJD2Q9UKL4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
GJD2Q9UKL4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
GJD2Q9UKL4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJD2Q9UKL4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJD2Q9UKL4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJD2Q9UKL4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
GJD2Q9UKL4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJD2Q9UKL4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJD2Q9UKL4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJD2Q9UKL4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJD2Q9UKL4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJD2Q9UKL4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJD2Q9UKL4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJD2Q9UKL4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJD2Q9UKL4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJD2Q9UKL4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GJD2Q9UKL4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GJD2Q9UKL4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GJD2Q9UKL4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJD2Q9UKL4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJD2Q9UKL4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJD2Q9UKL4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJD2Q9UKL4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJD2Q9UKL4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJD2Q9UKL4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms