Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW0

DCTN4, Dynactin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN4Q9UJW0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCTN4Q9UJW0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCTN4Q9UJW0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCTN4Q9UJW0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCTN4Q9UJW0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DCTN4Q9UJW0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCTN4Q9UJW0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCTN4Q9UJW0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCTN4Q9UJW0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCTN4Q9UJW0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCTN4Q9UJW0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCTN4Q9UJW0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCTN4Q9UJW0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCTN4Q9UJW0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCTN4Q9UJW0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCTN4Q9UJW0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCTN4Q9UJW0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCTN4Q9UJW0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DCTN4Q9UJW0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCTN4Q9UJW0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCTN4Q9UJW0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCTN4Q9UJW0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCTN4Q9UJW0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCTN4Q9UJW0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCTN4Q9UJW0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCTN4Q9UJW0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCTN4Q9UJW0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCTN4Q9UJW0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCTN4Q9UJW0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCTN4Q9UJW0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCTN4Q9UJW0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCTN4Q9UJW0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCTN4Q9UJW0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCTN4Q9UJW0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCTN4Q9UJW0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCTN4Q9UJW0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCTN4Q9UJW0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCTN4Q9UJW0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCTN4Q9UJW0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCTN4Q9UJW0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCTN4Q9UJW0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DCTN4Q9UJW0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DCTN4Q9UJW0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DCTN4Q9UJW0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCTN4Q9UJW0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCTN4Q9UJW0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCTN4Q9UJW0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCTN4Q9UJW0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCTN4Q9UJW0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCTN4Q9UJW0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCTN4Q9UJW0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCTN4Q9UJW0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCTN4Q9UJW0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCTN4Q9UJW0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DCTN4Q9UJW0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCTN4Q9UJW0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCTN4Q9UJW0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCTN4Q9UJW0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCTN4Q9UJW0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCTN4Q9UJW0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCTN4Q9UJW0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCTN4Q9UJW0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DCTN4Q9UJW0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCTN4Q9UJW0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCTN4Q9UJW0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCTN4Q9UJW0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCTN4Q9UJW0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCTN4Q9UJW0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCTN4Q9UJW0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCTN4Q9UJW0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCTN4Q9UJW0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCTN4Q9UJW0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DCTN4Q9UJW0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCTN4Q9UJW0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCTN4Q9UJW0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCTN4Q9UJW0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCTN4Q9UJW0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCTN4Q9UJW0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCTN4Q9UJW0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCTN4Q9UJW0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCTN4Q9UJW0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCTN4Q9UJW0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCTN4Q9UJW0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCTN4Q9UJW0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCTN4Q9UJW0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCTN4Q9UJW0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCTN4Q9UJW0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCTN4Q9UJW0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCTN4Q9UJW0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCTN4Q9UJW0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCTN4Q9UJW0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCTN4Q9UJW0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCTN4Q9UJW0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCTN4Q9UJW0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCTN4Q9UJW0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCTN4Q9UJW0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCTN4Q9UJW0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCTN4Q9UJW0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DCTN4Q9UJW0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCTN4Q9UJW0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms