Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ99

CDH22, Cadherin-22, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH22Q9UJ99 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDH22Q9UJ99 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CDH22Q9UJ99 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDH22Q9UJ99 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDH22Q9UJ99 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDH22Q9UJ99 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDH22Q9UJ99 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDH22Q9UJ99 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDH22Q9UJ99 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDH22Q9UJ99 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDH22Q9UJ99 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDH22Q9UJ99 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDH22Q9UJ99 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDH22Q9UJ99 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDH22Q9UJ99 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDH22Q9UJ99 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDH22Q9UJ99 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDH22Q9UJ99 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDH22Q9UJ99 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDH22Q9UJ99 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDH22Q9UJ99 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDH22Q9UJ99 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDH22Q9UJ99 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDH22Q9UJ99 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDH22Q9UJ99 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDH22Q9UJ99 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDH22Q9UJ99 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDH22Q9UJ99 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDH22Q9UJ99 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDH22Q9UJ99 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDH22Q9UJ99 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDH22Q9UJ99 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDH22Q9UJ99 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDH22Q9UJ99 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDH22Q9UJ99 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDH22Q9UJ99 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDH22Q9UJ99 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDH22Q9UJ99 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDH22Q9UJ99 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDH22Q9UJ99 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDH22Q9UJ99 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDH22Q9UJ99 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDH22Q9UJ99 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDH22Q9UJ99 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDH22Q9UJ99 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDH22Q9UJ99 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDH22Q9UJ99 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDH22Q9UJ99 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDH22Q9UJ99 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDH22Q9UJ99 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDH22Q9UJ99 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDH22Q9UJ99 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDH22Q9UJ99 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDH22Q9UJ99 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDH22Q9UJ99 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDH22Q9UJ99 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDH22Q9UJ99 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDH22Q9UJ99 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDH22Q9UJ99 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDH22Q9UJ99 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDH22Q9UJ99 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDH22Q9UJ99 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDH22Q9UJ99 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CDH22Q9UJ99 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDH22Q9UJ99 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDH22Q9UJ99 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDH22Q9UJ99 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CDH22Q9UJ99 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CDH22Q9UJ99 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CDH22Q9UJ99 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CDH22Q9UJ99 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CDH22Q9UJ99 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CDH22Q9UJ99 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDH22Q9UJ99 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDH22Q9UJ99 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDH22Q9UJ99 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDH22Q9UJ99 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CDH22Q9UJ99 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDH22Q9UJ99 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDH22Q9UJ99 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDH22Q9UJ99 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDH22Q9UJ99 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDH22Q9UJ99 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDH22Q9UJ99 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDH22Q9UJ99 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDH22Q9UJ99 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDH22Q9UJ99 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDH22Q9UJ99 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDH22Q9UJ99 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDH22Q9UJ99 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDH22Q9UJ99 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDH22Q9UJ99 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDH22Q9UJ99 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDH22Q9UJ99 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDH22Q9UJ99 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDH22Q9UJ99 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDH22Q9UJ99 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH22Q9UJ99 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH22Q9UJ99 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH22Q9UJ99 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms