Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPN3Q9UHW5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPN3Q9UHW5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GPN3Q9UHW5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GPN3Q9UHW5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GPN3Q9UHW5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GPN3Q9UHW5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GPN3Q9UHW5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GPN3Q9UHW5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GPN3Q9UHW5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GPN3Q9UHW5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GPN3Q9UHW5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GPN3Q9UHW5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GPN3Q9UHW5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GPN3Q9UHW5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GPN3Q9UHW5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GPN3Q9UHW5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GPN3Q9UHW5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GPN3Q9UHW5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GPN3Q9UHW5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GPN3Q9UHW5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GPN3Q9UHW5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GPN3Q9UHW5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GPN3Q9UHW5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GPN3Q9UHW5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GPN3Q9UHW5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GPN3Q9UHW5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPN3Q9UHW5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPN3Q9UHW5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPN3Q9UHW5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPN3Q9UHW5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPN3Q9UHW5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GPN3Q9UHW5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPN3Q9UHW5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPN3Q9UHW5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GPN3Q9UHW5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPN3Q9UHW5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPN3Q9UHW5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPN3Q9UHW5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPN3Q9UHW5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPN3Q9UHW5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPN3Q9UHW5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPN3Q9UHW5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPN3Q9UHW5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPN3Q9UHW5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPN3Q9UHW5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPN3Q9UHW5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPN3Q9UHW5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPN3Q9UHW5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GPN3Q9UHW5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPN3Q9UHW5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPN3Q9UHW5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPN3Q9UHW5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPN3Q9UHW5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPN3Q9UHW5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPN3Q9UHW5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPN3Q9UHW5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPN3Q9UHW5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPN3Q9UHW5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPN3Q9UHW5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPN3Q9UHW5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GPN3Q9UHW5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPN3Q9UHW5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPN3Q9UHW5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPN3Q9UHW5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPN3Q9UHW5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPN3Q9UHW5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPN3Q9UHW5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPN3Q9UHW5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPN3Q9UHW5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPN3Q9UHW5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPN3Q9UHW5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPN3Q9UHW5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GPN3Q9UHW5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPN3Q9UHW5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPN3Q9UHW5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPN3Q9UHW5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPN3Q9UHW5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPN3Q9UHW5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPN3Q9UHW5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPN3Q9UHW5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GPN3Q9UHW5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GPN3Q9UHW5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPN3Q9UHW5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPN3Q9UHW5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GPN3Q9UHW5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPN3Q9UHW5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPN3Q9UHW5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GPN3Q9UHW5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPN3Q9UHW5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPN3Q9UHW5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPN3Q9UHW5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPN3Q9UHW5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPN3Q9UHW5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPN3Q9UHW5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPN3Q9UHW5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GPN3Q9UHW5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPN3Q9UHW5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPN3Q9UHW5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPN3Q9UHW5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms