Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP25Q9UHP3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP25Q9UHP3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP25Q9UHP3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP25Q9UHP3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
USP25Q9UHP3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP25Q9UHP3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP25Q9UHP3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP25Q9UHP3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP25Q9UHP3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP25Q9UHP3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP25Q9UHP3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP25Q9UHP3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP25Q9UHP3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
USP25Q9UHP3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
USP25Q9UHP3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP25Q9UHP3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP25Q9UHP3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP25Q9UHP3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP25Q9UHP3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP25Q9UHP3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP25Q9UHP3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP25Q9UHP3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP25Q9UHP3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP25Q9UHP3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP25Q9UHP3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP25Q9UHP3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP25Q9UHP3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP25Q9UHP3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP25Q9UHP3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP25Q9UHP3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP25Q9UHP3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP25Q9UHP3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP25Q9UHP3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP25Q9UHP3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP25Q9UHP3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP25Q9UHP3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP25Q9UHP3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP25Q9UHP3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP25Q9UHP3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP25Q9UHP3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP25Q9UHP3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP25Q9UHP3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP25Q9UHP3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP25Q9UHP3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
USP25Q9UHP3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP25Q9UHP3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP25Q9UHP3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP25Q9UHP3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP25Q9UHP3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP25Q9UHP3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP25Q9UHP3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP25Q9UHP3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP25Q9UHP3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP25Q9UHP3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP25Q9UHP3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP25Q9UHP3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP25Q9UHP3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP25Q9UHP3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP25Q9UHP3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP25Q9UHP3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP25Q9UHP3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP25Q9UHP3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP25Q9UHP3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP25Q9UHP3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP25Q9UHP3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP25Q9UHP3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP25Q9UHP3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
USP25Q9UHP3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP25Q9UHP3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP25Q9UHP3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP25Q9UHP3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP25Q9UHP3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP25Q9UHP3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP25Q9UHP3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP25Q9UHP3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP25Q9UHP3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP25Q9UHP3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP25Q9UHP3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP25Q9UHP3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP25Q9UHP3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP25Q9UHP3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP25Q9UHP3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP25Q9UHP3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP25Q9UHP3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP25Q9UHP3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP25Q9UHP3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
USP25Q9UHP3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP25Q9UHP3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP25Q9UHP3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP25Q9UHP3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP25Q9UHP3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
USP25Q9UHP3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
USP25Q9UHP3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
USP25Q9UHP3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP25Q9UHP3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP25Q9UHP3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP25Q9UHP3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP25Q9UHP3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP25Q9UHP3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms