Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU0

TCF20, Transcription factor 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF20Q9UGU0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCF20Q9UGU0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TCF20Q9UGU0 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TCF20Q9UGU0 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TCF20Q9UGU0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TCF20Q9UGU0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TCF20Q9UGU0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TCF20Q9UGU0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TCF20Q9UGU0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCF20Q9UGU0 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCF20Q9UGU0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCF20Q9UGU0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCF20Q9UGU0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCF20Q9UGU0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCF20Q9UGU0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCF20Q9UGU0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCF20Q9UGU0 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCF20Q9UGU0 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCF20Q9UGU0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TCF20Q9UGU0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCF20Q9UGU0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCF20Q9UGU0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCF20Q9UGU0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCF20Q9UGU0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCF20Q9UGU0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCF20Q9UGU0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCF20Q9UGU0 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TCF20Q9UGU0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCF20Q9UGU0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCF20Q9UGU0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCF20Q9UGU0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCF20Q9UGU0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCF20Q9UGU0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCF20Q9UGU0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCF20Q9UGU0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCF20Q9UGU0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCF20Q9UGU0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCF20Q9UGU0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCF20Q9UGU0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCF20Q9UGU0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TCF20Q9UGU0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TCF20Q9UGU0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TCF20Q9UGU0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TCF20Q9UGU0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCF20Q9UGU0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCF20Q9UGU0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TCF20Q9UGU0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCF20Q9UGU0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TCF20Q9UGU0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TCF20Q9UGU0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TCF20Q9UGU0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TCF20Q9UGU0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TCF20Q9UGU0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TCF20Q9UGU0 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TCF20Q9UGU0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
TCF20Q9UGU0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TCF20Q9UGU0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCF20Q9UGU0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCF20Q9UGU0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCF20Q9UGU0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCF20Q9UGU0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCF20Q9UGU0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCF20Q9UGU0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCF20Q9UGU0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCF20Q9UGU0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCF20Q9UGU0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCF20Q9UGU0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCF20Q9UGU0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCF20Q9UGU0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCF20Q9UGU0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCF20Q9UGU0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCF20Q9UGU0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCF20Q9UGU0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TCF20Q9UGU0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCF20Q9UGU0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TCF20Q9UGU0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TCF20Q9UGU0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TCF20Q9UGU0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TCF20Q9UGU0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TCF20Q9UGU0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TCF20Q9UGU0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TCF20Q9UGU0 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TCF20Q9UGU0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TCF20Q9UGU0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCF20Q9UGU0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCF20Q9UGU0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCF20Q9UGU0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TCF20Q9UGU0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCF20Q9UGU0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCF20Q9UGU0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCF20Q9UGU0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCF20Q9UGU0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TCF20Q9UGU0 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TCF20Q9UGU0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TCF20Q9UGU0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TCF20Q9UGU0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TCF20Q9UGU0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TCF20Q9UGU0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TCF20Q9UGU0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TCF20Q9UGU0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms