Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNA9Q9UGM1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNA9Q9UGM1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNA9Q9UGM1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNA9Q9UGM1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNA9Q9UGM1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNA9Q9UGM1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNA9Q9UGM1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNA9Q9UGM1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNA9Q9UGM1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNA9Q9UGM1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNA9Q9UGM1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNA9Q9UGM1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNA9Q9UGM1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNA9Q9UGM1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNA9Q9UGM1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNA9Q9UGM1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNA9Q9UGM1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNA9Q9UGM1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRNA9Q9UGM1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRNA9Q9UGM1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRNA9Q9UGM1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRNA9Q9UGM1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRNA9Q9UGM1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRNA9Q9UGM1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRNA9Q9UGM1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRNA9Q9UGM1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRNA9Q9UGM1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRNA9Q9UGM1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRNA9Q9UGM1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRNA9Q9UGM1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRNA9Q9UGM1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRNA9Q9UGM1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRNA9Q9UGM1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRNA9Q9UGM1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRNA9Q9UGM1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRNA9Q9UGM1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRNA9Q9UGM1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRNA9Q9UGM1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRNA9Q9UGM1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRNA9Q9UGM1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRNA9Q9UGM1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRNA9Q9UGM1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRNA9Q9UGM1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRNA9Q9UGM1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRNA9Q9UGM1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRNA9Q9UGM1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRNA9Q9UGM1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRNA9Q9UGM1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHRNA9Q9UGM1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHRNA9Q9UGM1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHRNA9Q9UGM1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHRNA9Q9UGM1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHRNA9Q9UGM1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
CHRNA9Q9UGM1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHRNA9Q9UGM1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHRNA9Q9UGM1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHRNA9Q9UGM1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHRNA9Q9UGM1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHRNA9Q9UGM1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHRNA9Q9UGM1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHRNA9Q9UGM1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHRNA9Q9UGM1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNA9Q9UGM1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNA9Q9UGM1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNA9Q9UGM1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNA9Q9UGM1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNA9Q9UGM1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNA9Q9UGM1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNA9Q9UGM1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNA9Q9UGM1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNA9Q9UGM1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNA9Q9UGM1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNA9Q9UGM1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNA9Q9UGM1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNA9Q9UGM1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNA9Q9UGM1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNA9Q9UGM1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNA9Q9UGM1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNA9Q9UGM1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNA9Q9UGM1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNA9Q9UGM1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNA9Q9UGM1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNA9Q9UGM1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNA9Q9UGM1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNA9Q9UGM1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA9Q9UGM1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA9Q9UGM1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA9Q9UGM1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA9Q9UGM1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA9Q9UGM1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA9Q9UGM1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA9Q9UGM1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA9Q9UGM1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA9Q9UGM1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA9Q9UGM1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA9Q9UGM1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA9Q9UGM1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA9Q9UGM1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA9Q9UGM1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms