Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPARGC1AQ9UBK2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPARGC1AQ9UBK2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPARGC1AQ9UBK2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPARGC1AQ9UBK2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPARGC1AQ9UBK2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPARGC1AQ9UBK2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPARGC1AQ9UBK2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPARGC1AQ9UBK2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPARGC1AQ9UBK2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPARGC1AQ9UBK2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPARGC1AQ9UBK2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPARGC1AQ9UBK2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPARGC1AQ9UBK2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPARGC1AQ9UBK2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPARGC1AQ9UBK2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PPARGC1AQ9UBK2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPARGC1AQ9UBK2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPARGC1AQ9UBK2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPARGC1AQ9UBK2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPARGC1AQ9UBK2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPARGC1AQ9UBK2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPARGC1AQ9UBK2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPARGC1AQ9UBK2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPARGC1AQ9UBK2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPARGC1AQ9UBK2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPARGC1AQ9UBK2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPARGC1AQ9UBK2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPARGC1AQ9UBK2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPARGC1AQ9UBK2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPARGC1AQ9UBK2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPARGC1AQ9UBK2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPARGC1AQ9UBK2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPARGC1AQ9UBK2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPARGC1AQ9UBK2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPARGC1AQ9UBK2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPARGC1AQ9UBK2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPARGC1AQ9UBK2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPARGC1AQ9UBK2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPARGC1AQ9UBK2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPARGC1AQ9UBK2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPARGC1AQ9UBK2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPARGC1AQ9UBK2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPARGC1AQ9UBK2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPARGC1AQ9UBK2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPARGC1AQ9UBK2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PPARGC1AQ9UBK2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PPARGC1AQ9UBK2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPARGC1AQ9UBK2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPARGC1AQ9UBK2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPARGC1AQ9UBK2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPARGC1AQ9UBK2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPARGC1AQ9UBK2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPARGC1AQ9UBK2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPARGC1AQ9UBK2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPARGC1AQ9UBK2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPARGC1AQ9UBK2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPARGC1AQ9UBK2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPARGC1AQ9UBK2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPARGC1AQ9UBK2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPARGC1AQ9UBK2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPARGC1AQ9UBK2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPARGC1AQ9UBK2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPARGC1AQ9UBK2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPARGC1AQ9UBK2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPARGC1AQ9UBK2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPARGC1AQ9UBK2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPARGC1AQ9UBK2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPARGC1AQ9UBK2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPARGC1AQ9UBK2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPARGC1AQ9UBK2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPARGC1AQ9UBK2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPARGC1AQ9UBK2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPARGC1AQ9UBK2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPARGC1AQ9UBK2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPARGC1AQ9UBK2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPARGC1AQ9UBK2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPARGC1AQ9UBK2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPARGC1AQ9UBK2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPARGC1AQ9UBK2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPARGC1AQ9UBK2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPARGC1AQ9UBK2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPARGC1AQ9UBK2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPARGC1AQ9UBK2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPARGC1AQ9UBK2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPARGC1AQ9UBK2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPARGC1AQ9UBK2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPARGC1AQ9UBK2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPARGC1AQ9UBK2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPARGC1AQ9UBK2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPARGC1AQ9UBK2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPARGC1AQ9UBK2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPARGC1AQ9UBK2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPARGC1AQ9UBK2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPARGC1AQ9UBK2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPARGC1AQ9UBK2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.3 ms