Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B4

CTTNBP2NL, CTTNBP2 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2NLQ9P2B4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTTNBP2NLQ9P2B4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTTNBP2NLQ9P2B4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTTNBP2NLQ9P2B4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CTTNBP2NLQ9P2B4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTTNBP2NLQ9P2B4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTTNBP2NLQ9P2B4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTTNBP2NLQ9P2B4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTTNBP2NLQ9P2B4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTTNBP2NLQ9P2B4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTTNBP2NLQ9P2B4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTTNBP2NLQ9P2B4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTTNBP2NLQ9P2B4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTTNBP2NLQ9P2B4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTTNBP2NLQ9P2B4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTTNBP2NLQ9P2B4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTTNBP2NLQ9P2B4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTTNBP2NLQ9P2B4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTTNBP2NLQ9P2B4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTTNBP2NLQ9P2B4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTTNBP2NLQ9P2B4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTTNBP2NLQ9P2B4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTTNBP2NLQ9P2B4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTTNBP2NLQ9P2B4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTTNBP2NLQ9P2B4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTTNBP2NLQ9P2B4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTTNBP2NLQ9P2B4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTTNBP2NLQ9P2B4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTTNBP2NLQ9P2B4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTTNBP2NLQ9P2B4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CTTNBP2NLQ9P2B4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTTNBP2NLQ9P2B4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTTNBP2NLQ9P2B4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTTNBP2NLQ9P2B4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTTNBP2NLQ9P2B4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTTNBP2NLQ9P2B4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTTNBP2NLQ9P2B4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTTNBP2NLQ9P2B4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTTNBP2NLQ9P2B4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTTNBP2NLQ9P2B4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTTNBP2NLQ9P2B4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTTNBP2NLQ9P2B4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTTNBP2NLQ9P2B4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTTNBP2NLQ9P2B4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CTTNBP2NLQ9P2B4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTTNBP2NLQ9P2B4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTTNBP2NLQ9P2B4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTTNBP2NLQ9P2B4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTTNBP2NLQ9P2B4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTTNBP2NLQ9P2B4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTTNBP2NLQ9P2B4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTTNBP2NLQ9P2B4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTTNBP2NLQ9P2B4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTTNBP2NLQ9P2B4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTTNBP2NLQ9P2B4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTTNBP2NLQ9P2B4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTTNBP2NLQ9P2B4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTTNBP2NLQ9P2B4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTTNBP2NLQ9P2B4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTTNBP2NLQ9P2B4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTTNBP2NLQ9P2B4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTTNBP2NLQ9P2B4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTTNBP2NLQ9P2B4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTTNBP2NLQ9P2B4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTTNBP2NLQ9P2B4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTTNBP2NLQ9P2B4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTTNBP2NLQ9P2B4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTTNBP2NLQ9P2B4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTTNBP2NLQ9P2B4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTTNBP2NLQ9P2B4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTTNBP2NLQ9P2B4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTTNBP2NLQ9P2B4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTTNBP2NLQ9P2B4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTTNBP2NLQ9P2B4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTTNBP2NLQ9P2B4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTTNBP2NLQ9P2B4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTTNBP2NLQ9P2B4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTTNBP2NLQ9P2B4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTTNBP2NLQ9P2B4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTTNBP2NLQ9P2B4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTTNBP2NLQ9P2B4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTTNBP2NLQ9P2B4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTTNBP2NLQ9P2B4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTTNBP2NLQ9P2B4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTTNBP2NLQ9P2B4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.6 ms