Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN4

EHD2, EH domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD2Q9NZN4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EHD2Q9NZN4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EHD2Q9NZN4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EHD2Q9NZN4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
EHD2Q9NZN4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EHD2Q9NZN4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EHD2Q9NZN4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EHD2Q9NZN4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EHD2Q9NZN4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EHD2Q9NZN4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
EHD2Q9NZN4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
EHD2Q9NZN4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EHD2Q9NZN4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EHD2Q9NZN4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EHD2Q9NZN4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EHD2Q9NZN4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EHD2Q9NZN4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EHD2Q9NZN4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EHD2Q9NZN4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
EHD2Q9NZN4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EHD2Q9NZN4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EHD2Q9NZN4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EHD2Q9NZN4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EHD2Q9NZN4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EHD2Q9NZN4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EHD2Q9NZN4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EHD2Q9NZN4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EHD2Q9NZN4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EHD2Q9NZN4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EHD2Q9NZN4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EHD2Q9NZN4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EHD2Q9NZN4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EHD2Q9NZN4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EHD2Q9NZN4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EHD2Q9NZN4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
EHD2Q9NZN4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EHD2Q9NZN4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EHD2Q9NZN4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EHD2Q9NZN4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EHD2Q9NZN4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EHD2Q9NZN4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
EHD2Q9NZN4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EHD2Q9NZN4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EHD2Q9NZN4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EHD2Q9NZN4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EHD2Q9NZN4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EHD2Q9NZN4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EHD2Q9NZN4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EHD2Q9NZN4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EHD2Q9NZN4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EHD2Q9NZN4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
EHD2Q9NZN4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EHD2Q9NZN4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EHD2Q9NZN4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EHD2Q9NZN4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EHD2Q9NZN4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EHD2Q9NZN4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EHD2Q9NZN4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EHD2Q9NZN4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EHD2Q9NZN4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EHD2Q9NZN4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
EHD2Q9NZN4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EHD2Q9NZN4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EHD2Q9NZN4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EHD2Q9NZN4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
EHD2Q9NZN4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EHD2Q9NZN4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EHD2Q9NZN4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EHD2Q9NZN4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EHD2Q9NZN4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EHD2Q9NZN4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EHD2Q9NZN4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EHD2Q9NZN4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EHD2Q9NZN4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EHD2Q9NZN4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EHD2Q9NZN4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EHD2Q9NZN4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EHD2Q9NZN4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EHD2Q9NZN4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EHD2Q9NZN4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EHD2Q9NZN4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EHD2Q9NZN4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EHD2Q9NZN4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EHD2Q9NZN4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EHD2Q9NZN4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EHD2Q9NZN4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EHD2Q9NZN4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EHD2Q9NZN4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EHD2Q9NZN4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EHD2Q9NZN4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EHD2Q9NZN4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
EHD2Q9NZN4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EHD2Q9NZN4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EHD2Q9NZN4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EHD2Q9NZN4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EHD2Q9NZN4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
EHD2Q9NZN4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EHD2Q9NZN4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EHD2Q9NZN4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EHD2Q9NZN4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms