Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZG7

NINJ2, Ninjurin-2, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINJ2Q9NZG7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NINJ2Q9NZG7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NINJ2Q9NZG7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NINJ2Q9NZG7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NINJ2Q9NZG7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NINJ2Q9NZG7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NINJ2Q9NZG7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NINJ2Q9NZG7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NINJ2Q9NZG7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NINJ2Q9NZG7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NINJ2Q9NZG7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NINJ2Q9NZG7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NINJ2Q9NZG7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NINJ2Q9NZG7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NINJ2Q9NZG7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NINJ2Q9NZG7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NINJ2Q9NZG7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
NINJ2Q9NZG7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NINJ2Q9NZG7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NINJ2Q9NZG7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NINJ2Q9NZG7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NINJ2Q9NZG7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NINJ2Q9NZG7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NINJ2Q9NZG7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NINJ2Q9NZG7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NINJ2Q9NZG7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NINJ2Q9NZG7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NINJ2Q9NZG7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NINJ2Q9NZG7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NINJ2Q9NZG7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NINJ2Q9NZG7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NINJ2Q9NZG7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NINJ2Q9NZG7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NINJ2Q9NZG7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NINJ2Q9NZG7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NINJ2Q9NZG7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NINJ2Q9NZG7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NINJ2Q9NZG7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NINJ2Q9NZG7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NINJ2Q9NZG7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NINJ2Q9NZG7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NINJ2Q9NZG7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NINJ2Q9NZG7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NINJ2Q9NZG7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NINJ2Q9NZG7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NINJ2Q9NZG7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NINJ2Q9NZG7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NINJ2Q9NZG7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NINJ2Q9NZG7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NINJ2Q9NZG7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NINJ2Q9NZG7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NINJ2Q9NZG7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NINJ2Q9NZG7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NINJ2Q9NZG7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NINJ2Q9NZG7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NINJ2Q9NZG7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NINJ2Q9NZG7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NINJ2Q9NZG7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NINJ2Q9NZG7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NINJ2Q9NZG7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NINJ2Q9NZG7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NINJ2Q9NZG7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NINJ2Q9NZG7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NINJ2Q9NZG7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NINJ2Q9NZG7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NINJ2Q9NZG7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NINJ2Q9NZG7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NINJ2Q9NZG7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NINJ2Q9NZG7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NINJ2Q9NZG7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NINJ2Q9NZG7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NINJ2Q9NZG7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NINJ2Q9NZG7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NINJ2Q9NZG7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NINJ2Q9NZG7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NINJ2Q9NZG7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NINJ2Q9NZG7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NINJ2Q9NZG7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NINJ2Q9NZG7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NINJ2Q9NZG7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NINJ2Q9NZG7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NINJ2Q9NZG7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NINJ2Q9NZG7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NINJ2Q9NZG7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NINJ2Q9NZG7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NINJ2Q9NZG7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NINJ2Q9NZG7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NINJ2Q9NZG7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NINJ2Q9NZG7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NINJ2Q9NZG7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NINJ2Q9NZG7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NINJ2Q9NZG7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NINJ2Q9NZG7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NINJ2Q9NZG7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NINJ2Q9NZG7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NINJ2Q9NZG7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NINJ2Q9NZG7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NINJ2Q9NZG7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NINJ2Q9NZG7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NINJ2Q9NZG7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms