Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZA1

CLIC5, Chloride intracellular channel protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC5Q9NZA1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLIC5Q9NZA1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLIC5Q9NZA1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLIC5Q9NZA1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLIC5Q9NZA1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLIC5Q9NZA1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLIC5Q9NZA1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLIC5Q9NZA1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLIC5Q9NZA1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLIC5Q9NZA1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLIC5Q9NZA1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CLIC5Q9NZA1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLIC5Q9NZA1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLIC5Q9NZA1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLIC5Q9NZA1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLIC5Q9NZA1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLIC5Q9NZA1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CLIC5Q9NZA1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLIC5Q9NZA1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLIC5Q9NZA1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLIC5Q9NZA1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLIC5Q9NZA1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLIC5Q9NZA1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLIC5Q9NZA1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLIC5Q9NZA1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLIC5Q9NZA1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLIC5Q9NZA1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLIC5Q9NZA1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLIC5Q9NZA1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLIC5Q9NZA1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CLIC5Q9NZA1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLIC5Q9NZA1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLIC5Q9NZA1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLIC5Q9NZA1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CLIC5Q9NZA1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLIC5Q9NZA1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLIC5Q9NZA1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLIC5Q9NZA1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLIC5Q9NZA1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLIC5Q9NZA1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLIC5Q9NZA1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLIC5Q9NZA1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CLIC5Q9NZA1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CLIC5Q9NZA1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLIC5Q9NZA1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLIC5Q9NZA1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLIC5Q9NZA1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLIC5Q9NZA1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLIC5Q9NZA1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLIC5Q9NZA1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLIC5Q9NZA1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLIC5Q9NZA1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLIC5Q9NZA1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLIC5Q9NZA1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLIC5Q9NZA1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLIC5Q9NZA1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLIC5Q9NZA1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CLIC5Q9NZA1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLIC5Q9NZA1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLIC5Q9NZA1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLIC5Q9NZA1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLIC5Q9NZA1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLIC5Q9NZA1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLIC5Q9NZA1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLIC5Q9NZA1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLIC5Q9NZA1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLIC5Q9NZA1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLIC5Q9NZA1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLIC5Q9NZA1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CLIC5Q9NZA1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLIC5Q9NZA1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLIC5Q9NZA1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLIC5Q9NZA1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLIC5Q9NZA1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLIC5Q9NZA1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLIC5Q9NZA1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLIC5Q9NZA1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLIC5Q9NZA1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLIC5Q9NZA1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLIC5Q9NZA1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CLIC5Q9NZA1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CLIC5Q9NZA1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLIC5Q9NZA1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLIC5Q9NZA1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLIC5Q9NZA1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CLIC5Q9NZA1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CLIC5Q9NZA1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CLIC5Q9NZA1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CLIC5Q9NZA1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CLIC5Q9NZA1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLIC5Q9NZA1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLIC5Q9NZA1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLIC5Q9NZA1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLIC5Q9NZA1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLIC5Q9NZA1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLIC5Q9NZA1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CLIC5Q9NZA1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLIC5Q9NZA1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLIC5Q9NZA1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLIC5Q9NZA1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms