Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
C9orf78Q9NZ63 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
C9orf78Q9NZ63 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
C9orf78Q9NZ63 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
C9orf78Q9NZ63 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
C9orf78Q9NZ63 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
C9orf78Q9NZ63 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
C9orf78Q9NZ63 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
C9orf78Q9NZ63 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
C9orf78Q9NZ63 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
C9orf78Q9NZ63 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
C9orf78Q9NZ63 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
C9orf78Q9NZ63 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
C9orf78Q9NZ63 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
C9orf78Q9NZ63 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
C9orf78Q9NZ63 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
C9orf78Q9NZ63 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
C9orf78Q9NZ63 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
C9orf78Q9NZ63 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
C9orf78Q9NZ63 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
C9orf78Q9NZ63 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
C9orf78Q9NZ63 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
C9orf78Q9NZ63 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
C9orf78Q9NZ63 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
C9orf78Q9NZ63 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
C9orf78Q9NZ63 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
C9orf78Q9NZ63 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
C9orf78Q9NZ63 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
C9orf78Q9NZ63 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
C9orf78Q9NZ63 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
C9orf78Q9NZ63 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
C9orf78Q9NZ63 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
C9orf78Q9NZ63 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
C9orf78Q9NZ63 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
C9orf78Q9NZ63 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
C9orf78Q9NZ63 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
C9orf78Q9NZ63 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
C9orf78Q9NZ63 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
C9orf78Q9NZ63 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
C9orf78Q9NZ63 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
C9orf78Q9NZ63 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
C9orf78Q9NZ63 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
C9orf78Q9NZ63 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
C9orf78Q9NZ63 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
C9orf78Q9NZ63 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
C9orf78Q9NZ63 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
C9orf78Q9NZ63 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
C9orf78Q9NZ63 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
C9orf78Q9NZ63 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
C9orf78Q9NZ63 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
C9orf78Q9NZ63 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
C9orf78Q9NZ63 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
C9orf78Q9NZ63 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
C9orf78Q9NZ63 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
C9orf78Q9NZ63 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
C9orf78Q9NZ63 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
C9orf78Q9NZ63 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
C9orf78Q9NZ63 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
C9orf78Q9NZ63 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
C9orf78Q9NZ63 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
C9orf78Q9NZ63 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
C9orf78Q9NZ63 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
C9orf78Q9NZ63 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
C9orf78Q9NZ63 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
C9orf78Q9NZ63 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
C9orf78Q9NZ63 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
C9orf78Q9NZ63 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
C9orf78Q9NZ63 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
C9orf78Q9NZ63 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
C9orf78Q9NZ63 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
C9orf78Q9NZ63 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
C9orf78Q9NZ63 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
C9orf78Q9NZ63 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
C9orf78Q9NZ63 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
C9orf78Q9NZ63 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
C9orf78Q9NZ63 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
C9orf78Q9NZ63 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
C9orf78Q9NZ63 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
C9orf78Q9NZ63 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
C9orf78Q9NZ63 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
C9orf78Q9NZ63 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
C9orf78Q9NZ63 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
C9orf78Q9NZ63 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
C9orf78Q9NZ63 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
C9orf78Q9NZ63 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
C9orf78Q9NZ63 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
C9orf78Q9NZ63 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
C9orf78Q9NZ63 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
C9orf78Q9NZ63 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
C9orf78Q9NZ63 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
C9orf78Q9NZ63 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
C9orf78Q9NZ63 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
C9orf78Q9NZ63 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
C9orf78Q9NZ63 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
C9orf78Q9NZ63 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
C9orf78Q9NZ63 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
C9orf78Q9NZ63 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
C9orf78Q9NZ63 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
C9orf78Q9NZ63 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
C9orf78Q9NZ63 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
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