Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ53

PODXL2, Podocalyxin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXL2Q9NZ53 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PODXL2Q9NZ53 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PODXL2Q9NZ53 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PODXL2Q9NZ53 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PODXL2Q9NZ53 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PODXL2Q9NZ53 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PODXL2Q9NZ53 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PODXL2Q9NZ53 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PODXL2Q9NZ53 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PODXL2Q9NZ53 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PODXL2Q9NZ53 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PODXL2Q9NZ53 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PODXL2Q9NZ53 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PODXL2Q9NZ53 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PODXL2Q9NZ53 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PODXL2Q9NZ53 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PODXL2Q9NZ53 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PODXL2Q9NZ53 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PODXL2Q9NZ53 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PODXL2Q9NZ53 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PODXL2Q9NZ53 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PODXL2Q9NZ53 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PODXL2Q9NZ53 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PODXL2Q9NZ53 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PODXL2Q9NZ53 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PODXL2Q9NZ53 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PODXL2Q9NZ53 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PODXL2Q9NZ53 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PODXL2Q9NZ53 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PODXL2Q9NZ53 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PODXL2Q9NZ53 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PODXL2Q9NZ53 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PODXL2Q9NZ53 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PODXL2Q9NZ53 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PODXL2Q9NZ53 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PODXL2Q9NZ53 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PODXL2Q9NZ53 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PODXL2Q9NZ53 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PODXL2Q9NZ53 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PODXL2Q9NZ53 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PODXL2Q9NZ53 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PODXL2Q9NZ53 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PODXL2Q9NZ53 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PODXL2Q9NZ53 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PODXL2Q9NZ53 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PODXL2Q9NZ53 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PODXL2Q9NZ53 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PODXL2Q9NZ53 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PODXL2Q9NZ53 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PODXL2Q9NZ53 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PODXL2Q9NZ53 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PODXL2Q9NZ53 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PODXL2Q9NZ53 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PODXL2Q9NZ53 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PODXL2Q9NZ53 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PODXL2Q9NZ53 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PODXL2Q9NZ53 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PODXL2Q9NZ53 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PODXL2Q9NZ53 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PODXL2Q9NZ53 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PODXL2Q9NZ53 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PODXL2Q9NZ53 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PODXL2Q9NZ53 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PODXL2Q9NZ53 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PODXL2Q9NZ53 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PODXL2Q9NZ53 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PODXL2Q9NZ53 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PODXL2Q9NZ53 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PODXL2Q9NZ53 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PODXL2Q9NZ53 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PODXL2Q9NZ53 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PODXL2Q9NZ53 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PODXL2Q9NZ53 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PODXL2Q9NZ53 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PODXL2Q9NZ53 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PODXL2Q9NZ53 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PODXL2Q9NZ53 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PODXL2Q9NZ53 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PODXL2Q9NZ53 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PODXL2Q9NZ53 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PODXL2Q9NZ53 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PODXL2Q9NZ53 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PODXL2Q9NZ53 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PODXL2Q9NZ53 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PODXL2Q9NZ53 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PODXL2Q9NZ53 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PODXL2Q9NZ53 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PODXL2Q9NZ53 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PODXL2Q9NZ53 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PODXL2Q9NZ53 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PODXL2Q9NZ53 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PODXL2Q9NZ53 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PODXL2Q9NZ53 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PODXL2Q9NZ53 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PODXL2Q9NZ53 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PODXL2Q9NZ53 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PODXL2Q9NZ53 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PODXL2Q9NZ53 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PODXL2Q9NZ53 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PODXL2Q9NZ53 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms