Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
MIS18AQ9NYP9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MIS18AQ9NYP9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MIS18AQ9NYP9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MIS18AQ9NYP9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MIS18AQ9NYP9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MIS18AQ9NYP9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MIS18AQ9NYP9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MIS18AQ9NYP9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
MIS18AQ9NYP9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MIS18AQ9NYP9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MIS18AQ9NYP9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MIS18AQ9NYP9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MIS18AQ9NYP9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MIS18AQ9NYP9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MIS18AQ9NYP9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MIS18AQ9NYP9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MIS18AQ9NYP9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MIS18AQ9NYP9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MIS18AQ9NYP9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MIS18AQ9NYP9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MIS18AQ9NYP9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MIS18AQ9NYP9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MIS18AQ9NYP9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MIS18AQ9NYP9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MIS18AQ9NYP9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MIS18AQ9NYP9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MIS18AQ9NYP9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MIS18AQ9NYP9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MIS18AQ9NYP9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MIS18AQ9NYP9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MIS18AQ9NYP9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MIS18AQ9NYP9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MIS18AQ9NYP9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MIS18AQ9NYP9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MIS18AQ9NYP9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MIS18AQ9NYP9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MIS18AQ9NYP9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MIS18AQ9NYP9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MIS18AQ9NYP9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MIS18AQ9NYP9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MIS18AQ9NYP9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MIS18AQ9NYP9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MIS18AQ9NYP9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
MIS18AQ9NYP9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MIS18AQ9NYP9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MIS18AQ9NYP9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MIS18AQ9NYP9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MIS18AQ9NYP9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MIS18AQ9NYP9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MIS18AQ9NYP9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MIS18AQ9NYP9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MIS18AQ9NYP9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MIS18AQ9NYP9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MIS18AQ9NYP9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MIS18AQ9NYP9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MIS18AQ9NYP9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
MIS18AQ9NYP9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MIS18AQ9NYP9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MIS18AQ9NYP9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MIS18AQ9NYP9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MIS18AQ9NYP9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
MIS18AQ9NYP9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MIS18AQ9NYP9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MIS18AQ9NYP9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MIS18AQ9NYP9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MIS18AQ9NYP9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MIS18AQ9NYP9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MIS18AQ9NYP9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MIS18AQ9NYP9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MIS18AQ9NYP9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MIS18AQ9NYP9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MIS18AQ9NYP9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
MIS18AQ9NYP9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MIS18AQ9NYP9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MIS18AQ9NYP9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
MIS18AQ9NYP9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MIS18AQ9NYP9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MIS18AQ9NYP9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MIS18AQ9NYP9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
MIS18AQ9NYP9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MIS18AQ9NYP9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
MIS18AQ9NYP9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MIS18AQ9NYP9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
MIS18AQ9NYP9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MIS18AQ9NYP9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MIS18AQ9NYP9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MIS18AQ9NYP9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MIS18AQ9NYP9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MIS18AQ9NYP9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MIS18AQ9NYP9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MIS18AQ9NYP9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MIS18AQ9NYP9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MIS18AQ9NYP9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MIS18AQ9NYP9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
MIS18AQ9NYP9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MIS18AQ9NYP9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MIS18AQ9NYP9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MIS18AQ9NYP9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MIS18AQ9NYP9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms