Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PSD3Q9NYI0 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PSD3Q9NYI0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PSD3Q9NYI0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PSD3Q9NYI0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSD3Q9NYI0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSD3Q9NYI0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSD3Q9NYI0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSD3Q9NYI0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSD3Q9NYI0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSD3Q9NYI0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSD3Q9NYI0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSD3Q9NYI0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSD3Q9NYI0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSD3Q9NYI0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSD3Q9NYI0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSD3Q9NYI0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSD3Q9NYI0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSD3Q9NYI0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSD3Q9NYI0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSD3Q9NYI0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSD3Q9NYI0 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSD3Q9NYI0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSD3Q9NYI0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSD3Q9NYI0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSD3Q9NYI0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSD3Q9NYI0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSD3Q9NYI0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSD3Q9NYI0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSD3Q9NYI0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSD3Q9NYI0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSD3Q9NYI0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSD3Q9NYI0 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSD3Q9NYI0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSD3Q9NYI0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSD3Q9NYI0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSD3Q9NYI0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSD3Q9NYI0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSD3Q9NYI0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSD3Q9NYI0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSD3Q9NYI0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSD3Q9NYI0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSD3Q9NYI0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSD3Q9NYI0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSD3Q9NYI0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSD3Q9NYI0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSD3Q9NYI0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSD3Q9NYI0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSD3Q9NYI0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSD3Q9NYI0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PSD3Q9NYI0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSD3Q9NYI0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSD3Q9NYI0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSD3Q9NYI0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSD3Q9NYI0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSD3Q9NYI0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSD3Q9NYI0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSD3Q9NYI0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSD3Q9NYI0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSD3Q9NYI0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSD3Q9NYI0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSD3Q9NYI0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSD3Q9NYI0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSD3Q9NYI0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSD3Q9NYI0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSD3Q9NYI0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSD3Q9NYI0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSD3Q9NYI0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSD3Q9NYI0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSD3Q9NYI0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSD3Q9NYI0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSD3Q9NYI0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSD3Q9NYI0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
PSD3Q9NYI0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSD3Q9NYI0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSD3Q9NYI0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSD3Q9NYI0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PSD3Q9NYI0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSD3Q9NYI0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PSD3Q9NYI0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSD3Q9NYI0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSD3Q9NYI0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSD3Q9NYI0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PSD3Q9NYI0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSD3Q9NYI0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSD3Q9NYI0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PSD3Q9NYI0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PSD3Q9NYI0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PSD3Q9NYI0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PSD3Q9NYI0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PSD3Q9NYI0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSD3Q9NYI0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSD3Q9NYI0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSD3Q9NYI0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSD3Q9NYI0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSD3Q9NYI0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSD3Q9NYI0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PSD3Q9NYI0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSD3Q9NYI0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSD3Q9NYI0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms