Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYB5

SLCO1C1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1C1Q9NYB5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLCO1C1Q9NYB5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLCO1C1Q9NYB5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLCO1C1Q9NYB5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLCO1C1Q9NYB5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLCO1C1Q9NYB5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLCO1C1Q9NYB5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLCO1C1Q9NYB5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLCO1C1Q9NYB5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLCO1C1Q9NYB5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLCO1C1Q9NYB5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLCO1C1Q9NYB5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLCO1C1Q9NYB5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLCO1C1Q9NYB5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLCO1C1Q9NYB5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SLCO1C1Q9NYB5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLCO1C1Q9NYB5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLCO1C1Q9NYB5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLCO1C1Q9NYB5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLCO1C1Q9NYB5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLCO1C1Q9NYB5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLCO1C1Q9NYB5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLCO1C1Q9NYB5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLCO1C1Q9NYB5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLCO1C1Q9NYB5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLCO1C1Q9NYB5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLCO1C1Q9NYB5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLCO1C1Q9NYB5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLCO1C1Q9NYB5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLCO1C1Q9NYB5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLCO1C1Q9NYB5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLCO1C1Q9NYB5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLCO1C1Q9NYB5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLCO1C1Q9NYB5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLCO1C1Q9NYB5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLCO1C1Q9NYB5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLCO1C1Q9NYB5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SLCO1C1Q9NYB5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLCO1C1Q9NYB5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLCO1C1Q9NYB5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLCO1C1Q9NYB5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLCO1C1Q9NYB5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLCO1C1Q9NYB5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SLCO1C1Q9NYB5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLCO1C1Q9NYB5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLCO1C1Q9NYB5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLCO1C1Q9NYB5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLCO1C1Q9NYB5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLCO1C1Q9NYB5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLCO1C1Q9NYB5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLCO1C1Q9NYB5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLCO1C1Q9NYB5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLCO1C1Q9NYB5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLCO1C1Q9NYB5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLCO1C1Q9NYB5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLCO1C1Q9NYB5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLCO1C1Q9NYB5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLCO1C1Q9NYB5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLCO1C1Q9NYB5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLCO1C1Q9NYB5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLCO1C1Q9NYB5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLCO1C1Q9NYB5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLCO1C1Q9NYB5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLCO1C1Q9NYB5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLCO1C1Q9NYB5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLCO1C1Q9NYB5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLCO1C1Q9NYB5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLCO1C1Q9NYB5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLCO1C1Q9NYB5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLCO1C1Q9NYB5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLCO1C1Q9NYB5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLCO1C1Q9NYB5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLCO1C1Q9NYB5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLCO1C1Q9NYB5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLCO1C1Q9NYB5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLCO1C1Q9NYB5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLCO1C1Q9NYB5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLCO1C1Q9NYB5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLCO1C1Q9NYB5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLCO1C1Q9NYB5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLCO1C1Q9NYB5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLCO1C1Q9NYB5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SLCO1C1Q9NYB5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLCO1C1Q9NYB5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLCO1C1Q9NYB5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLCO1C1Q9NYB5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLCO1C1Q9NYB5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLCO1C1Q9NYB5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLCO1C1Q9NYB5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLCO1C1Q9NYB5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLCO1C1Q9NYB5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLCO1C1Q9NYB5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLCO1C1Q9NYB5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLCO1C1Q9NYB5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLCO1C1Q9NYB5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLCO1C1Q9NYB5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLCO1C1Q9NYB5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLCO1C1Q9NYB5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLCO1C1Q9NYB5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SLCO1C1Q9NYB5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms