Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA4

MTMR4, Myotubularin-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR4Q9NYA4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MTMR4Q9NYA4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
MTMR4Q9NYA4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MTMR4Q9NYA4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MTMR4Q9NYA4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MTMR4Q9NYA4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MTMR4Q9NYA4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MTMR4Q9NYA4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MTMR4Q9NYA4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MTMR4Q9NYA4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MTMR4Q9NYA4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MTMR4Q9NYA4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MTMR4Q9NYA4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MTMR4Q9NYA4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MTMR4Q9NYA4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
MTMR4Q9NYA4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MTMR4Q9NYA4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MTMR4Q9NYA4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MTMR4Q9NYA4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MTMR4Q9NYA4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
MTMR4Q9NYA4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MTMR4Q9NYA4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MTMR4Q9NYA4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MTMR4Q9NYA4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MTMR4Q9NYA4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
MTMR4Q9NYA4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
MTMR4Q9NYA4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MTMR4Q9NYA4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MTMR4Q9NYA4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MTMR4Q9NYA4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MTMR4Q9NYA4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MTMR4Q9NYA4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MTMR4Q9NYA4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MTMR4Q9NYA4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MTMR4Q9NYA4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MTMR4Q9NYA4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MTMR4Q9NYA4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MTMR4Q9NYA4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MTMR4Q9NYA4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
MTMR4Q9NYA4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MTMR4Q9NYA4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MTMR4Q9NYA4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
MTMR4Q9NYA4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
MTMR4Q9NYA4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
MTMR4Q9NYA4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
MTMR4Q9NYA4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
MTMR4Q9NYA4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
MTMR4Q9NYA4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MTMR4Q9NYA4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MTMR4Q9NYA4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MTMR4Q9NYA4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MTMR4Q9NYA4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MTMR4Q9NYA4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MTMR4Q9NYA4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MTMR4Q9NYA4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MTMR4Q9NYA4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MTMR4Q9NYA4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MTMR4Q9NYA4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MTMR4Q9NYA4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MTMR4Q9NYA4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MTMR4Q9NYA4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MTMR4Q9NYA4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MTMR4Q9NYA4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MTMR4Q9NYA4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MTMR4Q9NYA4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MTMR4Q9NYA4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MTMR4Q9NYA4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MTMR4Q9NYA4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MTMR4Q9NYA4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MTMR4Q9NYA4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MTMR4Q9NYA4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MTMR4Q9NYA4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MTMR4Q9NYA4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MTMR4Q9NYA4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MTMR4Q9NYA4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MTMR4Q9NYA4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MTMR4Q9NYA4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
MTMR4Q9NYA4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MTMR4Q9NYA4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MTMR4Q9NYA4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MTMR4Q9NYA4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MTMR4Q9NYA4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MTMR4Q9NYA4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MTMR4Q9NYA4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MTMR4Q9NYA4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
MTMR4Q9NYA4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MTMR4Q9NYA4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MTMR4Q9NYA4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MTMR4Q9NYA4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MTMR4Q9NYA4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MTMR4Q9NYA4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MTMR4Q9NYA4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MTMR4Q9NYA4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MTMR4Q9NYA4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MTMR4Q9NYA4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MTMR4Q9NYA4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MTMR4Q9NYA4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MTMR4Q9NYA4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MTMR4Q9NYA4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MTMR4Q9NYA4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms