Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TOR4AQ9NXH8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TOR4AQ9NXH8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TOR4AQ9NXH8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TOR4AQ9NXH8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TOR4AQ9NXH8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TOR4AQ9NXH8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TOR4AQ9NXH8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TOR4AQ9NXH8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TOR4AQ9NXH8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TOR4AQ9NXH8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TOR4AQ9NXH8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TOR4AQ9NXH8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TOR4AQ9NXH8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TOR4AQ9NXH8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TOR4AQ9NXH8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TOR4AQ9NXH8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TOR4AQ9NXH8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TOR4AQ9NXH8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TOR4AQ9NXH8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TOR4AQ9NXH8 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TOR4AQ9NXH8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TOR4AQ9NXH8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TOR4AQ9NXH8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TOR4AQ9NXH8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TOR4AQ9NXH8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TOR4AQ9NXH8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TOR4AQ9NXH8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TOR4AQ9NXH8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TOR4AQ9NXH8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TOR4AQ9NXH8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TOR4AQ9NXH8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TOR4AQ9NXH8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TOR4AQ9NXH8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TOR4AQ9NXH8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TOR4AQ9NXH8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TOR4AQ9NXH8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TOR4AQ9NXH8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TOR4AQ9NXH8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TOR4AQ9NXH8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TOR4AQ9NXH8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TOR4AQ9NXH8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TOR4AQ9NXH8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TOR4AQ9NXH8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TOR4AQ9NXH8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TOR4AQ9NXH8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TOR4AQ9NXH8 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TOR4AQ9NXH8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TOR4AQ9NXH8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TOR4AQ9NXH8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TOR4AQ9NXH8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TOR4AQ9NXH8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TOR4AQ9NXH8 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TOR4AQ9NXH8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TOR4AQ9NXH8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TOR4AQ9NXH8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TOR4AQ9NXH8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TOR4AQ9NXH8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TOR4AQ9NXH8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TOR4AQ9NXH8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TOR4AQ9NXH8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TOR4AQ9NXH8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TOR4AQ9NXH8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TOR4AQ9NXH8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TOR4AQ9NXH8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TOR4AQ9NXH8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TOR4AQ9NXH8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TOR4AQ9NXH8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TOR4AQ9NXH8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TOR4AQ9NXH8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TOR4AQ9NXH8 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TOR4AQ9NXH8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TOR4AQ9NXH8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TOR4AQ9NXH8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TOR4AQ9NXH8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TOR4AQ9NXH8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TOR4AQ9NXH8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TOR4AQ9NXH8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TOR4AQ9NXH8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TOR4AQ9NXH8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TOR4AQ9NXH8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TOR4AQ9NXH8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TOR4AQ9NXH8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TOR4AQ9NXH8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TOR4AQ9NXH8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TOR4AQ9NXH8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TOR4AQ9NXH8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TOR4AQ9NXH8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TOR4AQ9NXH8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TOR4AQ9NXH8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TOR4AQ9NXH8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TOR4AQ9NXH8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TOR4AQ9NXH8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TOR4AQ9NXH8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TOR4AQ9NXH8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TOR4AQ9NXH8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TOR4AQ9NXH8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TOR4AQ9NXH8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TOR4AQ9NXH8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TOR4AQ9NXH8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms